More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0231 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0231  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  668    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  76.67 
 
 		 330 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  76.06 
 
 		 330 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.17 
 
 		 210 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.6 
 
 		 210 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 209 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 210 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 277 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 228 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 240 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 212 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 215 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 214 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 228 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  43.08 
 
 		 204 aa  152  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 215 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.15 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  40.82 
 
 		 206 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 220 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  42.56 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.62 
 
 		 230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.55 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  38.78 
 
 		 219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 214 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 222 aa  146  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 214 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 214 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  43.37 
 
 		 208 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 212 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 226 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  41.05 
 
 		 212 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  41.05 
 
 		 212 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 208 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.27 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.62 
 
 		 215 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 247 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 206 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 212 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5708  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  40.61 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 224 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 224 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2317  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 209 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  39 
 
 		 218 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  40.62 
 
 		 212 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 212 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.38 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  39 
 
 		 213 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 		 207 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 214 aa  136  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  37.56 
 
 		 205 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  36.87 
 
 		 216 aa  135  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 214 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  39.8 
 
 		 205 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  34.74 
 
 		 205 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 219 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  36.13 
 
 		 205 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  37.31 
 
 		 205 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 207 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  38.38 
 
 		 205 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 213 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  34.72 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 208 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  35.08 
 
 		 205 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5185  two component LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 213 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3794  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 215 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.77 
 
 		 209 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 218 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  38.66 
 
 		 205 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  36.98 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.79 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 228 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 210 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  40.21 
 
 		 204 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  39.8 
 
 		 211 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 220 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 201 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 208 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 218 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 208 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  34.9 
 
 		 212 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  34.85 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 210 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 209 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 207 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 203 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 203 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 212 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>