More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2460 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  418  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  75.96 
 
 		 208 aa  339  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  67.98 
 
 		 203 aa  285  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.58 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  46.23 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  50.77 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  49.25 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  45.41 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  48.04 
 
 		 214 aa  185  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  42.72 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  42 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  48.13 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  44.95 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  43.14 
 
 		 205 aa  167  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  43.59 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.36 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  43.43 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  41.09 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  44.06 
 
 		 203 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  44 
 
 		 205 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.56 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  41.79 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  41.63 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.11 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  44.33 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.85 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  39.8 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  40.59 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  43.37 
 
 		 204 aa  157  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.71 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.54 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  38.94 
 
 		 205 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  40.59 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.05 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  38.07 
 
 		 216 aa  154  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  41.8 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  38.54 
 
 		 205 aa  154  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  154  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.58 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  44 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.08 
 
 		 201 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  38.19 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.19 
 
 		 228 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  40.51 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  39.49 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.49 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  39.15 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0534  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>