More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0268 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  410  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  67.98 
 
 		 210 aa  285  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  65.02 
 
 		 208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  68.81 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  60.49 
 
 		 218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.37 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  49.75 
 
 		 204 aa  197  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  47.45 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  48.47 
 
 		 214 aa  188  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  51.28 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  48.26 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 209 aa  187  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  46.89 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  46.23 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  44.39 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  44.62 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  43.65 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  46.07 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  47 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  44.62 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  44.67 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  49.73 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  44.9 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  47.72 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  44.9 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  45.69 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  43.88 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.7 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.65 
 
 		 214 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  43.65 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  43.65 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  43.65 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  43.65 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  43.65 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  43.65 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  43.65 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  43.65 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  44.79 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  39.9 
 
 		 216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  43.07 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.68 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02672  hypothetical protein  45.41 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 216 aa  160  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  43.59 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  42.08 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.13 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  40.41 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 213 aa  158  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 		 210 aa  157  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  44.62 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  42.78 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  44.85 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.1 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.1 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.53 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.13 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.27 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 208 aa  154  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  44.61 
 
 		 1483 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>