More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3918 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3918  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  62.93 
 
 		 209 aa  248  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  62.68 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.68 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  63.24 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 209 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 208 aa  234  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.4 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0209  two component LuxR family transcriptional regulator  59.8 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  58.85 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  54.77 
 
 		 198 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 202 aa  197  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  52.68 
 
 		 202 aa  197  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  52.2 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.5 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 207 aa  168  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3683  two component LuxR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00690698  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  42.86 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  43.65 
 
 		 215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  47.21 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  41.31 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.65 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  45.18 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.18 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.5 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.89 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  43.63 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.39 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  40.1 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  41.95 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  37.98 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  44.28 
 
 		 204 aa  145  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  39.42 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  40.59 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  41.87 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 203 aa  141  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 199 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  40.49 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  41.62 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.41 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  39.02 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 203 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.41 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  39 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  36.87 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>