More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1521 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1500  response regulator  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000401264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1521  response regulator  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1484  response regulator  99.06 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1784  response regulator  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1955  response regulator  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1065  two component LuxR family transcriptional regulator  56.85 
 
 		 206 aa  221  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0901  two component response regulator  50.8 
 
 		 196 aa  194  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 201 aa  177  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  42.21 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  43.23 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.23 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0467  two component LuxR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0534  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02672  hypothetical protein  44.04 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  44.5 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.27 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  44.5 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  43.68 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  42.11 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1438  LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  37.7 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 202 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  41.15 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2088  two component LuxR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  40.31 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  37.89 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.27 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.72 
 
 		 224 aa  141  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  39.27 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  36.65 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  41.36 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  38.74 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  40.53 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  39.57 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 209 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 216 aa  137  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  36.65 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2282  two component LuxR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  36.32 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  42.56 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.65 
 
 		 213 aa  134  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  39.04 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  43.01 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  42.41 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  39.58 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  37.77 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  39.69 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3602  LuxR response regulator receiver  39.22 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.66617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  36.6 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  37.89 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>