More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_09690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  96.7 
 
 		 212 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  77.99 
 
 		 246 aa  324  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  78.67 
 
 		 212 aa  321  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  68.93 
 
 		 209 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  65.26 
 
 		 216 aa  276  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  67.48 
 
 		 210 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  67.48 
 
 		 210 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.67 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  46.57 
 
 		 250 aa  174  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  44.9 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.21 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  42.05 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  42.56 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  39.59 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  40.39 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  43.59 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  41.58 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  43.09 
 
 		 204 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  39.71 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  39.3 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  38.92 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.38 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.59 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.09 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  44.93 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.7 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  40.3 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.09 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  40.84 
 
 		 233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 207 aa  151  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.97 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  37.44 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  36.82 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  38.92 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>