More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2774 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  42.27 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  41.09 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  42.41 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  40.51 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  39.59 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  39.18 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 210 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.84 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  43.43 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  40.1 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  42.05 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  42.56 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  42.93 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  40.62 
 
 		 205 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  41.15 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.38 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 207 aa  151  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  39.58 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  40.39 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  44.85 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  38.66 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  38.86 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  36.04 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  42.13 
 
 		 204 aa  148  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 250 aa  148  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  40.1 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  42.64 
 
 		 203 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 209 aa  147  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  42.29 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.3 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  36.46 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  40.51 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  39.81 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  40.62 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  36.22 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.26 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.07 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  36.27 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>