More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3813 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  100 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  83.02 
 
 		 213 aa  345  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  77.11 
 
 		 202 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  67 
 
 		 210 aa  260  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  53.3 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  52.48 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  52.28 
 
 		 205 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  55.61 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  51.78 
 
 		 205 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  50 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  51.27 
 
 		 205 aa  204  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  52.82 
 
 		 205 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  53.85 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  54.27 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.49 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  54.59 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 203 aa  177  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  47.03 
 
 		 204 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  44.9 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 207 aa  167  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.92 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  42.57 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  42.57 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  41.92 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1484  response regulator  41.88 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1521  response regulator  41.36 
 
 		 212 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1955  response regulator  41.36 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1500  response regulator  41.36 
 
 		 212 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000401264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1784  response regulator  41.36 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  41.92 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.59 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  41.79 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  42.78 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  36.51 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.72 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0467  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 200 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.22 
 
 		 200 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 208 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  42.25 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 208 aa  141  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  37.24 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  40.2 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  38.5 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 241 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  41.92 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  38.66 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  44.85 
 
 		 211 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  41.33 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0534  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  36.84 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  39.7 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 209 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  41.46 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  42.86 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 203 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>