More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2977 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  100 
 
 		 208 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 203 aa  187  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  43.65 
 
 		 205 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 203 aa  181  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  45.45 
 
 		 205 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  48.47 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  42.86 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  43.94 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  43.88 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  41.84 
 
 		 205 aa  167  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  43.56 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  41.62 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  44.1 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  39.22 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  39.9 
 
 		 205 aa  154  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  41.41 
 
 		 205 aa  154  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  42.57 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 202 aa  151  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  42.93 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  39.06 
 
 		 198 aa  147  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  45.66 
 
 		 205 aa  147  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  40.61 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  40.21 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  39.58 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.27 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  40.4 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.41 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  40 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  38.38 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  41.41 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  39.39 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  37.13 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  39.39 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  38.58 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 214 aa  137  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  39.9 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  37.76 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3188  response regulator receiver protein  38.54 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  34.55 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  43.15 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  40.4 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5418  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.39 
 
 		 774 aa  134  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2088  two component LuxR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>