More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4961 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  78.77 
 
 		 212 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 		 213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  45.64 
 
 		 205 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  45.64 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  47.45 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  44.97 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  46.52 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  46.39 
 
 		 202 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.99 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  51.78 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  44.97 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  44.97 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  43.39 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  44.16 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.91 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  43.16 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  48.17 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  44.79 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  46.32 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  52.22 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 202 aa  147  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.43 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  42.93 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  43.01 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  43 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1123  Fis family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  41.84 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  42.29 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  47 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 210 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  43 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 203 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  42.27 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 210 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 210 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  44 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  44.33 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>