More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3082 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  99 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  56.57 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  49.74 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.67 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.23 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  45.83 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  48.96 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  44.22 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  44.22 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  44.22 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  44.22 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  44.22 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  44.22 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  44.22 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  44.22 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  43.65 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  44.33 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.5 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.08 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  43.81 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  47.45 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  45.55 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.43 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  43.43 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.9 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.13 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  43.72 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  42 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  44.16 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  48.17 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  42.13 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.1 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  40.4 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 207 aa  151  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  44.56 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  42.49 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  45.26 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  44 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  39.18 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  40.93 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 210 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 210 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  41.5 
 
 		 210 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 209 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  40.93 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  40.21 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  38.78 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  39.59 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.79 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.69 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>