More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3850 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  90.43 
 
 		 209 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  91.83 
 
 		 208 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  86.34 
 
 		 209 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  76.56 
 
 		 211 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  39.15 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  40.61 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  38.19 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  40.82 
 
 		 210 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.95 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  39.2 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  38.89 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  38.38 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3545  regulatory protein, LuxR  40.98 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.350632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  40.93 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  39.8 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  39.59 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  36.5 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  39.11 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  38.19 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  37.81 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  37.37 
 
 		 205 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 210 aa  137  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  36.92 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  35.38 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.49 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  40 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  36.79 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  36.79 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  35.96 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  38.97 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  41.97 
 
 		 215 aa  134  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 205 aa  134  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  39.5 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>