21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2183 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  62.9 
 
 		 690 aa  669    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  62.9 
 
 		 690 aa  669    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  75.91 
 
 		 640 aa  875    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  62.9 
 
 		 690 aa  669    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 660 aa  1255    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  50.1 
 
 		 865 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  46.53 
 
 		 562 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  31.38 
 
 		 880 aa  210  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  31.7 
 
 		 864 aa  157  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11227  hypothetical protein  58.22 
 
 		 194 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  32.17 
 
 		 867 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 884 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 		 884 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 879 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 868 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 871 aa  65.1  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 893 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  33.74 
 
 		 845 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 926 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  32.87 
 
 		 292 aa  53.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 894 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>