More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  100 
 
 		 903 aa  1765    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 845 aa  107  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 879 aa  106  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  32.96 
 
 		 867 aa  101  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 926 aa  97.8  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 880 aa  94  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  28.35 
 
 		 908 aa  90.9  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 864 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 907 aa  81.3  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 894 aa  81.3  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 		 1001 aa  81.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  28.67 
 
 		 868 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  31.05 
 
 		 884 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  28.67 
 
 		 893 aa  72.8  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  27.4 
 
 		 865 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.79 
 
 		 997 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  27.19 
 
 		 884 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  58.18 
 
 		 881 aa  63.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 910 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  58.82 
 
 		 90 aa  62.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  50 
 
 		 92 aa  62.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  58.18 
 
 		 876 aa  62.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  62.75 
 
 		 959 aa  62  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  40.86 
 
 		 905 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  56.86 
 
 		 91 aa  61.6  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 927 aa  61.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  54.39 
 
 		 934 aa  60.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 178 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 178 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  44.21 
 
 		 955 aa  59.7  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  52.83 
 
 		 90 aa  59.3  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 92 aa  58.9  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 92 aa  58.5  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  58.82 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 956 aa  58.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  40.51 
 
 		 900 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 895 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 950 aa  58.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  53.85 
 
 		 923 aa  57.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 		 871 aa  57.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 893 aa  57.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 960 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.91 
 
 		 221 aa  57  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  46.97 
 
 		 337 aa  57.4  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  43.56 
 
 		 1104 aa  57  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  55.36 
 
 		 827 aa  57  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 904 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  52.54 
 
 		 961 aa  57  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 435 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  43.24 
 
 		 893 aa  57  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 368 aa  57  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.35 
 
 		 862 aa  57  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 258 aa  56.6  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 231 aa  55.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 952 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  51.92 
 
 		 574 aa  55.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 952 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 910 aa  55.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 231 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  48.57 
 
 		 953 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 92 aa  55.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 889 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  45.24 
 
 		 196 aa  55.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 894 aa  55.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 556 aa  55.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  49.18 
 
 		 929 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  52.94 
 
 		 92 aa  55.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  52.94 
 
 		 92 aa  55.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  45.24 
 
 		 196 aa  55.8  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  52.94 
 
 		 92 aa  55.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  29.1 
 
 		 943 aa  55.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 1030 aa  55.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 919 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  58 
 
 		 928 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 923 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 956 aa  55.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 196 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  56.86 
 
 		 228 aa  54.7  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  38.38 
 
 		 903 aa  55.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 946 aa  54.7  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 970 aa  54.7  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 213 aa  54.7  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 909 aa  54.7  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 867 aa  54.7  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  52 
 
 		 567 aa  54.7  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  54.7  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 211 aa  54.7  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.66 
 
 		 907 aa  54.7  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 231 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 231 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  53.9  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  50.94 
 
 		 776 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 		 952 aa  54.3  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  32.64 
 
 		 918 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 895 aa  54.3  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 908 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 244 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>