More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4183 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  68.84 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  68.37 
 
 		 222 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  44.71 
 
 		 216 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  43.19 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.48 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.04 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.47 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  40.27 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.09 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 213 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  38.83 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.12 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  41.87 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  41.9 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.27 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  40.28 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  38.97 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.07 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  39.91 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.2 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  40.62 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.64 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.71 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  39.62 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  36.53 
 
 		 238 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  36.32 
 
 		 234 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  37.28 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  39.62 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  37.85 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  34.12 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.08 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  40.67 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.09 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.29 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>