More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2130 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  100 
 
 		 222 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  96.85 
 
 		 222 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  68.84 
 
 		 220 aa  299  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 229 aa  197  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  44.13 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.26 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  45.12 
 
 		 221 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  43.26 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.41 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 209 aa  161  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 218 aa  159  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.74 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  38.5 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  36.92 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.64 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  36.57 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.64 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.65 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  39.56 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.77 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  41.31 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  36.97 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  39.46 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  39.32 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  39.62 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.37 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  37.26 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  41.26 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.01 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  40 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.29 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  38.81 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.55 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 		 236 aa  148  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 212 aa  148  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.01 
 
 		 227 aa  147  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.99 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.36 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>