More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1156 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
919 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  49.89 
 
 
921 aa  676    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  45.3 
 
 
919 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  49.89 
 
 
921 aa  676    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  48.25 
 
 
919 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  66.74 
 
 
921 aa  1031    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  45.08 
 
 
919 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  49.89 
 
 
921 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  100 
 
 
900 aa  1747    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  48.1 
 
 
929 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  42.6 
 
 
977 aa  555  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 
923 aa  184  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 
913 aa  183  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 
916 aa  178  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  27.91 
 
 
917 aa  167  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 
998 aa  162  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 
997 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  30.41 
 
 
905 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  34.32 
 
 
922 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 
903 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  28.03 
 
 
923 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
889 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  31.42 
 
 
915 aa  132  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  32.72 
 
 
928 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  28.4 
 
 
995 aa  128  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  30.22 
 
 
923 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  34.35 
 
 
928 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  34.09 
 
 
884 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  34.94 
 
 
893 aa  118  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 
927 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  37.13 
 
 
910 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  29.45 
 
 
953 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.04 
 
 
919 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 
925 aa  111  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  32.54 
 
 
879 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 
929 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  32.87 
 
 
934 aa  105  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 
894 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  30.47 
 
 
884 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  27.55 
 
 
998 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  32.62 
 
 
892 aa  101  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  34.08 
 
 
910 aa  101  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  31.26 
 
 
913 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  30.89 
 
 
955 aa  100  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  31.89 
 
 
918 aa  99.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  32.92 
 
 
913 aa  98.6  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  33.24 
 
 
950 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  26.68 
 
 
953 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 
940 aa  94  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 
911 aa  93.6  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 
928 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.88 
 
 
1006 aa  90.1  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
937 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  31.7 
 
 
937 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  31.78 
 
 
937 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  37.24 
 
 
1052 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  22.07 
 
 
1147 aa  85.1  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  26.01 
 
 
918 aa  85.1  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 
938 aa  85.1  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  39.22 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 
897 aa  84.7  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  36.36 
 
 
923 aa  81.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.23 
 
 
983 aa  80.9  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 
951 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 
973 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 
929 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 
959 aa  77.8  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  38.13 
 
 
916 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  28.09 
 
 
937 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 
909 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  67.24 
 
 
948 aa  75.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.1 
 
 
1175 aa  75.5  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  30.15 
 
 
927 aa  74.3  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  31.99 
 
 
1064 aa  74.3  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.41 
 
 
1264 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 
946 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.15 
 
 
1150 aa  73.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  34.47 
 
 
947 aa  72.8  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  56.36 
 
 
855 aa  72.4  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  26.96 
 
 
900 aa  71.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  31.39 
 
 
936 aa  71.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  28.97 
 
 
1148 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.08 
 
 
992 aa  70.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 
876 aa  70.5  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  31.56 
 
 
541 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  29.8 
 
 
956 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
544 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 
932 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
544 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 
920 aa  70.1  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
544 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  29.53 
 
 
963 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  28.95 
 
 
927 aa  69.3  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  61.54 
 
 
960 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
877 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  26.92 
 
 
1216 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 
952 aa  67.8  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  30.04 
 
 
1071 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  27.04 
 
 
1029 aa  67.4  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  37.14 
 
 
940 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>