More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4504 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
919 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  47.91 
 
 
921 aa  683    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  44.85 
 
 
919 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  47.91 
 
 
921 aa  683    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  77.61 
 
 
919 aa  1296    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  49.95 
 
 
921 aa  697    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  44.74 
 
 
919 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  48.13 
 
 
921 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  47.87 
 
 
900 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  100 
 
 
929 aa  1836    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  43.79 
 
 
977 aa  612  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  31.72 
 
 
884 aa  189  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  31.26 
 
 
925 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  31.52 
 
 
884 aa  178  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  30.59 
 
 
913 aa  172  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  29.57 
 
 
934 aa  169  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 
916 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 
940 aa  153  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  28.09 
 
 
920 aa  153  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  36.03 
 
 
997 aa  148  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
889 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  33.6 
 
 
922 aa  137  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 
915 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  30.2 
 
 
916 aa  128  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  39.44 
 
 
919 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  33.23 
 
 
938 aa  122  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 
995 aa  121  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  40.89 
 
 
910 aa  115  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 
923 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  33.59 
 
 
955 aa  114  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  28.12 
 
 
916 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 
913 aa  108  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  34.98 
 
 
917 aa  108  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  33.51 
 
 
940 aa  107  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  30.89 
 
 
879 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  33.25 
 
 
928 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  35.57 
 
 
893 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 
909 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  31.06 
 
 
913 aa  102  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  33.23 
 
 
928 aa  101  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 
929 aa  99.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  24.55 
 
 
998 aa  99.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.13 
 
 
1006 aa  97.4  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 
927 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 
953 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  33.21 
 
 
923 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  31.18 
 
 
541 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  31.68 
 
 
923 aa  94.4  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  28.4 
 
 
923 aa  93.2  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  31.04 
 
 
928 aa  92.8  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  31.72 
 
 
961 aa  92  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
544 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
881 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
544 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
881 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
544 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
876 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 
911 aa  88.6  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 
894 aa  87.4  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  34.3 
 
 
959 aa  87.4  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 
918 aa  87.4  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  34.86 
 
 
910 aa  86.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
1000 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  29.49 
 
 
937 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
937 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  29.49 
 
 
937 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  35.33 
 
 
189 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  34.16 
 
 
905 aa  84.7  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
950 aa  84.3  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 
951 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 
998 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 
982 aa  81.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  46.34 
 
 
946 aa  81.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 
1052 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 
927 aa  79  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  31.79 
 
 
929 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.52 
 
 
1067 aa  78.2  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  31.49 
 
 
930 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 
932 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  29.74 
 
 
919 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  29.53 
 
 
892 aa  75.1  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 
918 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  29.52 
 
 
960 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.45 
 
 
992 aa  74.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30 
 
 
1118 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  34.03 
 
 
897 aa  73.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 
973 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  37.17 
 
 
947 aa  73.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 
952 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
877 aa  72.4  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  32.12 
 
 
908 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  27.93 
 
 
936 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  35.67 
 
 
948 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 
904 aa  69.3  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  26.45 
 
 
927 aa  69.7  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  33.83 
 
 
855 aa  69.3  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
552 aa  69.7  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.95 
 
 
713 aa  68.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  30.07 
 
 
956 aa  68.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.09 
 
 
1029 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>