More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3894 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 897 aa  1790    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 919 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  26.38 
 
 		 919 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  25.96 
 
 		 919 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  35.81 
 
 		 919 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  33.66 
 
 		 937 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 937 aa  94.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  33.66 
 
 		 937 aa  94.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  37.13 
 
 		 921 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 913 aa  90.5  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  27.37 
 
 		 928 aa  87.4  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  31.44 
 
 		 904 aa  86.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  36.46 
 
 		 940 aa  85.9  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  28.33 
 
 		 911 aa  86.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  35.79 
 
 		 923 aa  85.5  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  32.62 
 
 		 903 aa  85.9  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  30.72 
 
 		 927 aa  85.1  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 		 923 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  35.11 
 
 		 929 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  35.71 
 
 		 977 aa  84.7  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  26.96 
 
 		 946 aa  82.4  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  31.64 
 
 		 918 aa  82  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  34.69 
 
 		 930 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  33.19 
 
 		 917 aa  81.6  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  28.8 
 
 		 925 aa  81.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  29.02 
 
 		 918 aa  81.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  27.6 
 
 		 913 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 894 aa  81.3  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  35.6 
 
 		 879 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  37.08 
 
 		 910 aa  80.1  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  36.08 
 
 		 884 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  25.57 
 
 		 940 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  35.45 
 
 		 955 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  29.64 
 
 		 953 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 		 905 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  31.52 
 
 		 1052 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  34.9 
 
 		 921 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 921 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  34.9 
 
 		 921 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 927 aa  77  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  36.92 
 
 		 961 aa  76.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  29.09 
 
 		 934 aa  75.1  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  32.88 
 
 		 913 aa  74.7  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  31.85 
 
 		 995 aa  74.3  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  34.1 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  34.03 
 
 		 929 aa  70.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  26.01 
 
 		 923 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 929 aa  70.1  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 909 aa  68.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 		 928 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 920 aa  67.8  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  26.21 
 
 		 919 aa  67.8  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  27.27 
 
 		 928 aa  67.8  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  35.23 
 
 		 900 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.79 
 
 		 910 aa  66.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  31.09 
 
 		 894 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 876 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 915 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 877 aa  64.7  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.6 
 
 		 923 aa  64.3  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  29.9 
 
 		 919 aa  64.7  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  32.05 
 
 		 893 aa  63.9  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  33.18 
 
 		 884 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  50.79 
 
 		 855 aa  63.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  26.02 
 
 		 922 aa  63.9  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  28.49 
 
 		 1064 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 950 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 959 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 		 916 aa  61.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  28.5 
 
 		 936 aa  61.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  35.11 
 
 		 959 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 889 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 1216 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33440  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.85 
 
 		 938 aa  59.7  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 882 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  29.06 
 
 		 943 aa  58.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  27.05 
 
 		 916 aa  58.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  33.54 
 
 		 998 aa  57.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 336 aa  57  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 814 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 		 947 aa  57  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 1137 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 215 aa  56.2  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 119 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  34.48 
 
 		 229 aa  55.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 775 aa  55.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.26 
 
 		 953 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 981 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 228 aa  55.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  38.57 
 
 		 228 aa  54.7  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 912 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 208 aa  53.9  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 910 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3488  response regulator receiver  43.24 
 
 		 229 aa  53.9  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.920048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 		 919 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 230 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 216 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 219 aa  53.5  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>