More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5515 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  100 
 
 		 879 aa  1687    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 940 aa  521  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  42.2 
 
 		 917 aa  515  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  42.97 
 
 		 995 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  45.02 
 
 		 913 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  41.19 
 
 		 919 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.49 
 
 		 923 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  37.64 
 
 		 928 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  37.61 
 
 		 884 aa  349  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  36.17 
 
 		 909 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 835 aa  310  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  34.98 
 
 		 913 aa  308  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 911 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  35.37 
 
 		 928 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.02 
 
 		 938 aa  296  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 904 aa  293  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  33.4 
 
 		 946 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  36.68 
 
 		 910 aa  283  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 927 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  35.66 
 
 		 923 aa  281  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 928 aa  271  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  33.26 
 
 		 925 aa  270  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  32.49 
 
 		 930 aa  264  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  34.76 
 
 		 940 aa  264  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 937 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  33.44 
 
 		 937 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 920 aa  258  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  32.89 
 
 		 937 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  33.14 
 
 		 929 aa  249  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 894 aa  238  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 950 aa  231  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  33.3 
 
 		 903 aa  227  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  36.12 
 
 		 913 aa  227  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 905 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 918 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  34.28 
 
 		 929 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 936 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  33.69 
 
 		 934 aa  222  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  33.3 
 
 		 892 aa  214  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  30.74 
 
 		 922 aa  211  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  32.19 
 
 		 919 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  34.08 
 
 		 961 aa  199  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  31.82 
 
 		 955 aa  196  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  36.91 
 
 		 916 aa  191  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  36.65 
 
 		 884 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 927 aa  189  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 919 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  29.76 
 
 		 919 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  29.87 
 
 		 919 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 923 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 953 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  37.22 
 
 		 923 aa  124  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  34.18 
 
 		 977 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 889 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 1064 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  42.11 
 
 		 240 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  33.84 
 
 		 921 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  32.17 
 
 		 921 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 921 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  27.24 
 
 		 893 aa  99.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.85 
 
 		 921 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.22 
 
 		 998 aa  94.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 915 aa  94.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  39.38 
 
 		 929 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 1000 aa  84.3  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 881 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 881 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 894 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  35.6 
 
 		 897 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 236 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  39.04 
 
 		 189 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 997 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 951 aa  78.2  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  40.14 
 
 		 959 aa  77.8  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 974 aa  77  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  31.02 
 
 		 900 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  40.82 
 
 		 910 aa  76.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  34.8 
 
 		 541 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 981 aa  72  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 953 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 877 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 946 aa  68.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  34.81 
 
 		 932 aa  67.8  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 940 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  37.82 
 
 		 919 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.62 
 
 		 981 aa  65.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  37.62 
 
 		 574 aa  65.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  44.29 
 
 		 887 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 882 aa  65.1  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 918 aa  64.7  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  40.43 
 
 		 943 aa  64.7  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 960 aa  64.3  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2675  Tetratricopeptide TPR_4  57.41 
 
 		 870 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00129539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 956 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 927 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.53 
 
 		 947 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 937 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  42.17 
 
 		 876 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 862 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 218 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>