More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4558 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
952 aa  1783    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  41.68 
 
 
974 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  40.92 
 
 
998 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 
951 aa  409  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 
948 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  39.21 
 
 
947 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  40.63 
 
 
946 aa  386  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  38.74 
 
 
932 aa  369  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 
943 aa  317  8e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  37.81 
 
 
960 aa  301  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 
940 aa  296  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  32.34 
 
 
925 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  50.18 
 
 
1104 aa  184  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  28.74 
 
 
943 aa  160  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  35.39 
 
 
855 aa  135  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
994 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  39.16 
 
 
939 aa  125  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 
908 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.23 
 
 
1146 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  44.85 
 
 
947 aa  111  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  43.03 
 
 
877 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  32.2 
 
 
855 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  32.26 
 
 
1151 aa  101  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.45 
 
 
1029 aa  101  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  30.83 
 
 
786 aa  101  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 
983 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  31.04 
 
 
1022 aa  97.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  27.9 
 
 
919 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  45.36 
 
 
910 aa  94  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
919 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  27.11 
 
 
919 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.61 
 
 
1339 aa  92.8  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  31.83 
 
 
923 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  33.71 
 
 
956 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 
1403 aa  89.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  39.38 
 
 
940 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  35.63 
 
 
919 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
937 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  39.13 
 
 
937 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  39.13 
 
 
937 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
940 aa  88.2  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  32.41 
 
 
956 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.03 
 
 
1118 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 
938 aa  85.9  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  31.77 
 
 
723 aa  85.5  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  34.54 
 
 
919 aa  84.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.52 
 
 
1080 aa  84.7  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  37.02 
 
 
941 aa  84  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  31.58 
 
 
934 aa  84  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  34.67 
 
 
917 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  28.15 
 
 
1013 aa  83.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  28.93 
 
 
1141 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  28.93 
 
 
1141 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  36.16 
 
 
923 aa  81.6  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.6 
 
 
1160 aa  81.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
895 aa  81.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  30.41 
 
 
931 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  33.59 
 
 
955 aa  80.9  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  35 
 
 
879 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.74 
 
 
1264 aa  80.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 
995 aa  80.1  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.19 
 
 
713 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  28.68 
 
 
1141 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  39.87 
 
 
905 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
913 aa  79.7  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  30.42 
 
 
965 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  38.27 
 
 
925 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.34 
 
 
992 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.36 
 
 
1048 aa  79  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.04 
 
 
1081 aa  78.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
973 aa  79  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.83 
 
 
1190 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  28.33 
 
 
1216 aa  78.2  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.36 
 
 
1015 aa  77.8  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  28.89 
 
 
927 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.79 
 
 
1075 aa  77.8  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  35.67 
 
 
1074 aa  77.4  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.98 
 
 
1141 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  33.26 
 
 
913 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.18 
 
 
923 aa  77.4  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  42.54 
 
 
921 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 
927 aa  77.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 
918 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  32.94 
 
 
913 aa  77.4  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
921 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 
919 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  42.54 
 
 
921 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.27 
 
 
1908 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 
1064 aa  75.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  31.13 
 
 
872 aa  75.5  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  27.14 
 
 
919 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  41.91 
 
 
884 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 
953 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.81 
 
 
1141 aa  74.7  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.77 
 
 
1055 aa  74.7  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  33.12 
 
 
923 aa  74.7  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.46 
 
 
1023 aa  74.3  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.4 
 
 
900 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
889 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  29.56 
 
 
1063 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>