More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2729 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  100 
 
 
892 aa  1687    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  46.87 
 
 
928 aa  640    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  48.34 
 
 
927 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  37.47 
 
 
928 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  39.78 
 
 
884 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 
909 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  35.44 
 
 
922 aa  324  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  35.07 
 
 
919 aa  315  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  36.43 
 
 
961 aa  309  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
889 aa  309  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  35.34 
 
 
923 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  33.86 
 
 
923 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  35.42 
 
 
934 aa  292  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 
929 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  36.14 
 
 
929 aa  273  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 
946 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  33.74 
 
 
925 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 
904 aa  259  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  34.81 
 
 
918 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.19 
 
 
938 aa  254  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  35.78 
 
 
913 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  34.24 
 
 
919 aa  230  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  42.3 
 
 
930 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  33.74 
 
 
879 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 
995 aa  222  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  40.53 
 
 
953 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  41.14 
 
 
920 aa  213  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  37.19 
 
 
955 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
937 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  43.65 
 
 
937 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.87 
 
 
923 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  43.65 
 
 
937 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  43.49 
 
 
940 aa  191  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  41.42 
 
 
911 aa  188  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  37.14 
 
 
913 aa  187  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  36.33 
 
 
923 aa  180  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  41.53 
 
 
905 aa  177  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  40.49 
 
 
913 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  38.87 
 
 
884 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  39.12 
 
 
910 aa  160  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  39.77 
 
 
936 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  32.72 
 
 
917 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  36.73 
 
 
927 aa  137  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
919 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  31.98 
 
 
919 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  31.98 
 
 
919 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  43.89 
 
 
240 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 
910 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  28.24 
 
 
893 aa  114  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 
916 aa  114  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  39.76 
 
 
915 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  31.32 
 
 
927 aa  105  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  40.89 
 
 
903 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  32 
 
 
900 aa  102  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  50.41 
 
 
928 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 
959 aa  98.2  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  33.24 
 
 
940 aa  96.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 
916 aa  96.3  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 
894 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  29.83 
 
 
977 aa  91.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
921 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  33.12 
 
 
921 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  33.44 
 
 
921 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  43.65 
 
 
894 aa  89.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  40.44 
 
 
1064 aa  89  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  30.19 
 
 
921 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.19 
 
 
997 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
1000 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  29.33 
 
 
919 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
881 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
881 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
876 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
950 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  33.24 
 
 
940 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 
967 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  43.45 
 
 
189 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.29 
 
 
1227 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  47.32 
 
 
946 aa  82  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
973 aa  80.1  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 
959 aa  79.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.29 
 
 
954 aa  78.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 
900 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 
998 aa  77  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  36.95 
 
 
948 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 
947 aa  77  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  29.25 
 
 
929 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.98 
 
 
1190 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  31.27 
 
 
1052 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 
992 aa  75.5  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.6 
 
 
1006 aa  75.5  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  27.99 
 
 
786 aa  74.3  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
236 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  29.06 
 
 
937 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  43.09 
 
 
947 aa  72  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.75 
 
 
1193 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.4 
 
 
1029 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
895 aa  70.5  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.02 
 
 
1075 aa  70.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 
932 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 
956 aa  67.8  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>