More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2041 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
927 aa  1779    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 
925 aa  349  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  36.74 
 
 
923 aa  338  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  35.31 
 
 
928 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 
903 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  35.11 
 
 
930 aa  308  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 
905 aa  303  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
950 aa  290  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  35.52 
 
 
919 aa  285  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 
919 aa  268  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  34.16 
 
 
929 aa  262  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  33.95 
 
 
936 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  33.05 
 
 
884 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  43.87 
 
 
940 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 
911 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  41.33 
 
 
913 aa  198  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 
909 aa  195  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  36.08 
 
 
918 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  39.36 
 
 
937 aa  194  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
937 aa  193  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  39.48 
 
 
937 aa  193  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 
904 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 
928 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  39.68 
 
 
913 aa  178  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  37.42 
 
 
927 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  36.22 
 
 
922 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  36.06 
 
 
928 aa  173  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  30.86 
 
 
879 aa  171  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 
946 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 
938 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  38.84 
 
 
913 aa  157  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  36.83 
 
 
955 aa  152  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 
923 aa  150  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  36.73 
 
 
892 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  37.09 
 
 
929 aa  149  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 
953 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
889 aa  144  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 
940 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  36.71 
 
 
934 aa  142  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  36.87 
 
 
961 aa  137  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 
920 aa  127  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  46.07 
 
 
894 aa  125  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  38.65 
 
 
884 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  39.91 
 
 
240 aa  118  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  37.71 
 
 
1064 aa  114  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  40.62 
 
 
923 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 
910 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  32.3 
 
 
916 aa  105  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.25 
 
 
923 aa  103  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 
995 aa  99.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  32.3 
 
 
917 aa  94.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  36.69 
 
 
915 aa  93.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
876 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  27.7 
 
 
910 aa  88.2  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  35.26 
 
 
189 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  48.54 
 
 
953 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  29.4 
 
 
1000 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  30.72 
 
 
897 aa  85.1  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  32.49 
 
 
946 aa  84.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  43.09 
 
 
894 aa  84  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
919 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  33.73 
 
 
919 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  31.47 
 
 
929 aa  81.3  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 
959 aa  80.5  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
927 aa  79.7  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  28.67 
 
 
919 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  37.76 
 
 
998 aa  77  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  32.99 
 
 
977 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  33.78 
 
 
960 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 
951 aa  75.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  38.58 
 
 
981 aa  75.5  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  38.74 
 
 
974 aa  75.1  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  30 
 
 
900 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 
835 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  29.13 
 
 
921 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  31.08 
 
 
921 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
921 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.08 
 
 
921 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
236 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
877 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  32.14 
 
 
1123 aa  68.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  40.71 
 
 
947 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.54 
 
 
1227 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 
997 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.91 
 
 
1029 aa  64.3  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  51.61 
 
 
957 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 
939 aa  63.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
421 aa  63.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  55.36 
 
 
963 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  41.84 
 
 
952 aa  62.4  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.36 
 
 
998 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
221 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.85 
 
 
981 aa  60.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 
908 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 
940 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  52.73 
 
 
963 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  35.55 
 
 
916 aa  59.7  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
775 aa  59.3  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
1030 aa  59.3  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.24 
 
 
1422 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>