More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4161 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  53.79 
 
 		 881 aa  806    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  53.79 
 
 		 881 aa  806    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 893 aa  1734    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  53.13 
 
 		 876 aa  803    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  47.16 
 
 		 894 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  44.72 
 
 		 910 aa  531  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1352  tetratricopeptide TPR_4  50.07 
 
 		 683 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  32.97 
 
 		 927 aa  302  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 959 aa  265  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 189 aa  248  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 1000 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.76 
 
 		 953 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  28.18 
 
 		 928 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  29.28 
 
 		 919 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  31.26 
 
 		 938 aa  114  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  35.74 
 
 		 921 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  26.44 
 
 		 917 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  34.57 
 
 		 900 aa  98.6  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  29.28 
 
 		 921 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 921 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  29.28 
 
 		 921 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 937 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 937 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 937 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  27.26 
 
 		 911 aa  93.2  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  36.18 
 
 		 910 aa  92.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  38.22 
 
 		 940 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  35.57 
 
 		 929 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40 
 
 		 923 aa  90.9  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 904 aa  90.5  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 889 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  39.31 
 
 		 894 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  33.64 
 
 		 977 aa  89  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 905 aa  88.6  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  43.7 
 
 		 927 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 903 aa  87.8  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 236 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 877 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 919 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  32.44 
 
 		 919 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  32 
 
 		 919 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 995 aa  84  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 541 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 940 aa  82.8  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  34 
 
 		 918 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  32.51 
 
 		 930 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  31.17 
 
 		 913 aa  82.8  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  35.08 
 
 		 913 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  37.09 
 
 		 929 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 974 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 936 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  44.17 
 
 		 913 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  34.54 
 
 		 919 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 998 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  38.56 
 
 		 928 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 925 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  37.19 
 
 		 928 aa  78.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 545 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 879 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  39.5 
 
 		 884 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 		 923 aa  75.5  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  36.36 
 
 		 884 aa  75.1  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 		 947 aa  74.7  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  34.81 
 
 		 923 aa  74.3  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 		 923 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  29.38 
 
 		 907 aa  73.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 908 aa  72.8  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  41.32 
 
 		 892 aa  72.8  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  36.96 
 
 		 929 aa  71.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 946 aa  71.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 919 aa  71.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  33.54 
 
 		 574 aa  70.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  37.13 
 
 		 835 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 1064 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 882 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  36.81 
 
 		 920 aa  69.7  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 		 953 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  34.23 
 
 		 951 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 960 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  39.83 
 
 		 909 aa  68.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 		 916 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  38.69 
 
 		 932 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  33.52 
 
 		 973 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  27.24 
 
 		 925 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 554 aa  66.6  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  28.86 
 
 		 943 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  41.86 
 
 		 567 aa  65.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  58.82 
 
 		 1085 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.9 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 1137 aa  65.1  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  31.53 
 
 		 963 aa  64.7  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  34.19 
 
 		 915 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 897 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  28.07 
 
 		 955 aa  64.3  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 1085 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  32.82 
 
 		 956 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>