More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1429 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
932 aa  1761    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  38.7 
 
 
952 aa  313  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 
947 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 
943 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 
960 aa  204  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  34.74 
 
 
855 aa  144  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  51.11 
 
 
946 aa  138  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 
998 aa  133  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  38.44 
 
 
951 aa  130  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  52.3 
 
 
974 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  32.35 
 
 
925 aa  128  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  49.73 
 
 
948 aa  118  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  29.21 
 
 
855 aa  118  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  49.72 
 
 
940 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  30.7 
 
 
1054 aa  108  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.76 
 
 
1146 aa  105  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.52 
 
 
1118 aa  105  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
877 aa  104  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.87 
 
 
900 aa  101  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  29.09 
 
 
723 aa  99  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.02 
 
 
1339 aa  98.6  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  29.06 
 
 
1051 aa  98.2  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.2 
 
 
947 aa  97.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 
927 aa  94.4  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  32.47 
 
 
956 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
973 aa  91.3  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  28.34 
 
 
943 aa  90.5  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  45.52 
 
 
894 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.85 
 
 
1121 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  27.68 
 
 
1029 aa  84.7  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 
956 aa  84  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  43.07 
 
 
1104 aa  84  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.65 
 
 
1029 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 
931 aa  82  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.88 
 
 
992 aa  82  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
937 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  36.22 
 
 
937 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  36.22 
 
 
937 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  29.92 
 
 
1013 aa  81.3  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  43.05 
 
 
881 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 
910 aa  81.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  43.05 
 
 
881 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  42.76 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 
983 aa  80.9  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  43.05 
 
 
876 aa  80.9  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.5 
 
 
967 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.66 
 
 
1190 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  29.43 
 
 
1685 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.58 
 
 
1015 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  43.44 
 
 
921 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  42.95 
 
 
884 aa  78.2  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  31.7 
 
 
908 aa  78.2  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  43.44 
 
 
921 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  43.44 
 
 
921 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.57 
 
 
919 aa  78.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  28.29 
 
 
1151 aa  77.8  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 
939 aa  77.8  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 
925 aa  77.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 
894 aa  77.4  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  43.39 
 
 
336 aa  77  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
975 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  29.45 
 
 
922 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  29.75 
 
 
1685 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  30.81 
 
 
1071 aa  75.5  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 
928 aa  75.1  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  47.32 
 
 
889 aa  75.1  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.95 
 
 
1193 aa  75.1  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 
1403 aa  74.7  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  39.64 
 
 
917 aa  73.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.63 
 
 
1141 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  26.89 
 
 
1022 aa  73.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.48 
 
 
1075 aa  73.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 
905 aa  73.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  28.81 
 
 
955 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 
910 aa  72.8  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  28.04 
 
 
1148 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.42 
 
 
1150 aa  72.4  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  34.39 
 
 
940 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 
1005 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 
929 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  31.06 
 
 
1139 aa  70.5  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.07 
 
 
1067 aa  70.1  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  23.58 
 
 
670 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  39.42 
 
 
928 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  32.41 
 
 
981 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  30.68 
 
 
919 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  27.42 
 
 
1141 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  27.42 
 
 
1141 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  36.55 
 
 
955 aa  68.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 
938 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  40.12 
 
 
923 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  35.78 
 
 
929 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  41.59 
 
 
892 aa  68.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.92 
 
 
1797 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  28.79 
 
 
923 aa  68.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  65.52 
 
 
963 aa  68.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  32.71 
 
 
879 aa  68.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.77 
 
 
954 aa  68.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  35.33 
 
 
919 aa  68.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  27.11 
 
 
1048 aa  68.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>