More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4935 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  50.1 
 
 		 1051 aa  828    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  54.41 
 
 		 1054 aa  914    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 1029 aa  2016    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  31.7 
 
 		 1123 aa  171  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  35.35 
 
 		 1114 aa  164  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  31.95 
 
 		 1022 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  30.62 
 
 		 1123 aa  161  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  28.78 
 
 		 1121 aa  154  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.75 
 
 		 1150 aa  151  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  30.2 
 
 		 1071 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 1118 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  28.66 
 
 		 1132 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 1015 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  33.69 
 
 		 954 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 900 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 983 aa  127  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  28.88 
 
 		 1118 aa  127  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  33.43 
 
 		 1067 aa  124  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 1198 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.98 
 
 		 1029 aa  121  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 967 aa  118  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  30.49 
 
 		 982 aa  117  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  33.25 
 
 		 981 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  30.75 
 
 		 970 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 1141 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 1161 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 973 aa  115  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 992 aa  115  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  28.84 
 
 		 723 aa  115  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 1141 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 1141 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 1141 aa  114  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  30.51 
 
 		 916 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 1148 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.2 
 
 		 1006 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  30.02 
 
 		 1005 aa  112  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  28.88 
 
 		 1090 aa  111  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  25.28 
 
 		 993 aa  110  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0735  hypothetical protein  66.32 
 
 		 112 aa  110  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0480212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  32.91 
 
 		 1036 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 		 1013 aa  105  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 895 aa  104  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.54 
 
 		 1055 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.99 
 
 		 1808 aa  101  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  31.05 
 
 		 1153 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  32.43 
 
 		 964 aa  100  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 		 1398 aa  99  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  31.61 
 
 		 938 aa  99  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.5 
 
 		 966 aa  98.2  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.06 
 
 		 1291 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 1942 aa  96.3  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.69 
 
 		 1712 aa  97.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  31.47 
 
 		 953 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.63 
 
 		 1797 aa  95.5  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 1020 aa  95.1  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.33 
 
 		 1013 aa  93.2  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  30.25 
 
 		 1084 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.58 
 
 		 1871 aa  92.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.86 
 
 		 1780 aa  92  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.91 
 
 		 1805 aa  92  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.48 
 
 		 1105 aa  91.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 1116 aa  91.3  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  25.17 
 
 		 1123 aa  91.3  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  29.52 
 
 		 1122 aa  91.3  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  24.72 
 
 		 1134 aa  91.3  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  27.55 
 
 		 1833 aa  90.9  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  27.54 
 
 		 1934 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.11 
 
 		 1780 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  24.56 
 
 		 1811 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.26 
 
 		 1080 aa  90.1  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  25.28 
 
 		 1850 aa  89.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  25.21 
 
 		 2272 aa  89.4  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 		 670 aa  89.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.27 
 
 		 1795 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.49 
 
 		 1160 aa  89  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  30.25 
 
 		 967 aa  89  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  30.58 
 
 		 1118 aa  89  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4548  ATPase-like protein  36.49 
 
 		 1053 aa  89  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.9 
 
 		 2303 aa  88.6  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  23.51 
 
 		 1227 aa  88.6  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  31.94 
 
 		 862 aa  88.6  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.35 
 
 		 1081 aa  87.8  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  25.17 
 
 		 1046 aa  87.8  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.69 
 
 		 2017 aa  87.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 		 1142 aa  87.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.36 
 
 		 1908 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.77 
 
 		 1141 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  27.92 
 
 		 2109 aa  87  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 952 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 881 aa  87  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 952 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  30.52 
 
 		 872 aa  86.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  30.56 
 
 		 1118 aa  86.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  30.75 
 
 		 959 aa  85.5  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.33 
 
 		 1055 aa  85.9  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  25.84 
 
 		 2361 aa  85.1  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.92 
 
 		 1089 aa  85.1  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.67 
 
 		 1175 aa  84.7  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 		 1235 aa  84.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.52 
 
 		 1075 aa  84.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>