More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5676 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 953 aa  1758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  42.9 
 
 		 993 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  44.31 
 
 		 983 aa  438  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  38.37 
 
 		 916 aa  362  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  38.19 
 
 		 970 aa  348  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  35.86 
 
 		 982 aa  345  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 967 aa  332  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  34.88 
 
 		 1006 aa  311  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 992 aa  273  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  33.37 
 
 		 967 aa  270  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  41.09 
 
 		 954 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  39.4 
 
 		 981 aa  213  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 		 1005 aa  211  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  34.77 
 
 		 964 aa  211  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 1084 aa  210  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 973 aa  197  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  34.22 
 
 		 1013 aa  172  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  38.45 
 
 		 999 aa  158  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 959 aa  149  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 		 937 aa  141  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 		 900 aa  138  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  34.64 
 
 		 1022 aa  121  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.9 
 
 		 1029 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 895 aa  102  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 1118 aa  101  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  32.46 
 
 		 905 aa  99.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  29.66 
 
 		 1105 aa  99.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  34.74 
 
 		 1123 aa  99.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 1116 aa  99  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.71 
 
 		 1291 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  33.78 
 
 		 1118 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  33.78 
 
 		 1118 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.88 
 
 		 1089 aa  95.1  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  32.34 
 
 		 1054 aa  94  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 		 1403 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.92 
 
 		 1029 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 1198 aa  89.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  31 
 
 		 1067 aa  86.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 1400 aa  87  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.41 
 
 		 1175 aa  86.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.66 
 
 		 1080 aa  86.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.85 
 
 		 1403 aa  85.1  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.97 
 
 		 1048 aa  84.7  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  30.04 
 
 		 1139 aa  84.3  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  31.78 
 
 		 1071 aa  84.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.78 
 
 		 1139 aa  84.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.73 
 
 		 1081 aa  84.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  29.5 
 
 		 864 aa  83.2  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.6 
 
 		 1034 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 1015 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  35.7 
 
 		 957 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.5 
 
 		 1271 aa  82  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  31.05 
 
 		 914 aa  81.6  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  30.6 
 
 		 1007 aa  81.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.03 
 
 		 1149 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.58 
 
 		 1422 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 		 1340 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 881 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.03 
 
 		 1227 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  21.65 
 
 		 1147 aa  80.1  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  31.14 
 
 		 723 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  28.17 
 
 		 1037 aa  79  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.35 
 
 		 1160 aa  78.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 1141 aa  77.8  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 1141 aa  77.8  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 1141 aa  77.8  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  32.23 
 
 		 1043 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 		 1050 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.6 
 
 		 1050 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 1148 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  33.06 
 
 		 1121 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 1297 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.54 
 
 		 1148 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.91 
 
 		 1151 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.16 
 
 		 1193 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 1320 aa  75.5  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.52 
 
 		 1441 aa  75.5  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  29.79 
 
 		 1122 aa  75.5  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 		 1151 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 1141 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 1020 aa  74.7  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.75 
 
 		 1142 aa  74.7  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.28 
 
 		 1126 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  34.52 
 
 		 1101 aa  74.3  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  26.86 
 
 		 1114 aa  74.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  29.2 
 
 		 862 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.94 
 
 		 1055 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.09 
 
 		 2017 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  28.01 
 
 		 1134 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 		 956 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 1349 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  30.89 
 
 		 1133 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  32.32 
 
 		 963 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 1349 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 		 1383 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  28.47 
 
 		 1264 aa  72.8  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  24.82 
 
 		 670 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.61 
 
 		 1094 aa  72.8  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  30.4 
 
 		 1123 aa  72.4  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.11 
 
 		 1150 aa  72  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>