More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6954 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
1005 aa  1961    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  33.79 
 
 
992 aa  332  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 
954 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  32.7 
 
 
916 aa  277  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  31.05 
 
 
1084 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  30.68 
 
 
967 aa  265  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.18 
 
 
983 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 
900 aa  253  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 
993 aa  251  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
973 aa  245  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  31.21 
 
 
964 aa  242  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 
981 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  29.22 
 
 
1013 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  33.26 
 
 
1006 aa  181  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 
982 aa  180  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  34.01 
 
 
970 aa  177  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  35.64 
 
 
953 aa  157  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 
959 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 
937 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  26.87 
 
 
1020 aa  126  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  28.62 
 
 
1198 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.41 
 
 
1080 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.85 
 
 
1118 aa  121  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25.66 
 
 
1134 aa  119  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.27 
 
 
1175 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.98 
 
 
1029 aa  116  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 
1148 aa  116  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.04 
 
 
1422 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.59 
 
 
1089 aa  115  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.48 
 
 
1429 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
881 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.34 
 
 
1081 aa  111  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  25.73 
 
 
864 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.18 
 
 
1160 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.57 
 
 
1123 aa  105  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  24.5 
 
 
1015 aa  105  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  26.63 
 
 
1141 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.63 
 
 
1141 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.63 
 
 
1141 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.68 
 
 
1067 aa  102  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.43 
 
 
1139 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.39 
 
 
1141 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  26.85 
 
 
1138 aa  99.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  34.14 
 
 
981 aa  98.6  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.49 
 
 
1094 aa  98.2  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.89 
 
 
1122 aa  97.8  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.51 
 
 
1151 aa  97.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  27.64 
 
 
1148 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  20.58 
 
 
1147 aa  97.1  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.39 
 
 
1029 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.29 
 
 
1151 aa  95.9  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 
1142 aa  95.5  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  26.88 
 
 
1141 aa  95.5  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  28.4 
 
 
973 aa  95.1  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  28.93 
 
 
1054 aa  94.7  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.39 
 
 
1291 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  26.26 
 
 
1051 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  28.72 
 
 
1013 aa  92.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.55 
 
 
1441 aa  92.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  23.61 
 
 
1093 aa  90.9  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  28.13 
 
 
1116 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  30.49 
 
 
862 aa  89.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  26.33 
 
 
1311 aa  89.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.43 
 
 
1264 aa  89.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.61 
 
 
1109 aa  89.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.64 
 
 
1055 aa  89  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  24.49 
 
 
1055 aa  89  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  25.95 
 
 
872 aa  88.6  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.54 
 
 
1105 aa  88.6  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 
1400 aa  88.6  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  27.63 
 
 
1114 aa  88.2  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  26.47 
 
 
1071 aa  88.2  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  27.56 
 
 
723 aa  88.2  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  27.62 
 
 
1121 aa  87.8  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  26.5 
 
 
998 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  31.34 
 
 
1153 aa  86.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.65 
 
 
1149 aa  87  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  26.91 
 
 
1150 aa  87  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  29.06 
 
 
965 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  25.94 
 
 
977 aa  86.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 
1007 aa  87  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  29.62 
 
 
937 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.78 
 
 
1685 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.42 
 
 
1666 aa  85.5  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  27.84 
 
 
1123 aa  84.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
1340 aa  84  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  25.54 
 
 
1398 aa  84.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  28.64 
 
 
1685 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  27.66 
 
 
1118 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
895 aa  82.4  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.31 
 
 
1403 aa  81.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  27.66 
 
 
1118 aa  81.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  26.88 
 
 
928 aa  80.9  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  28.09 
 
 
1027 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  28.09 
 
 
1027 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
1030 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.48 
 
 
1037 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.03 
 
 
1797 aa  79  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  23.92 
 
 
2051 aa  79  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  29.47 
 
 
2109 aa  79  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>