More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1734 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  100 
 
 
977 aa  1914    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  35.23 
 
 
1020 aa  320  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.56 
 
 
1105 aa  154  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.94 
 
 
1149 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
973 aa  118  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  25.71 
 
 
1139 aa  115  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.73 
 
 
1117 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 
967 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.83 
 
 
992 aa  111  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  28.79 
 
 
959 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.17 
 
 
954 aa  105  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  24.65 
 
 
1403 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  26.52 
 
 
1138 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 
1398 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.92 
 
 
1141 aa  102  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  24.93 
 
 
1148 aa  101  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.65 
 
 
1151 aa  99.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.34 
 
 
1029 aa  98.6  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  28.14 
 
 
1022 aa  98.6  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.15 
 
 
1151 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  27.99 
 
 
993 aa  97.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  25.36 
 
 
1122 aa  96.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.63 
 
 
1015 aa  95.9  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 
982 aa  94  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.26 
 
 
1080 aa  94.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.35 
 
 
1134 aa  92.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.67 
 
 
1175 aa  92  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.9 
 
 
713 aa  91.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.27 
 
 
1227 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  28.6 
 
 
983 aa  90.1  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.3 
 
 
1005 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.2 
 
 
1081 aa  88.6  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.44 
 
 
900 aa  88.6  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.19 
 
 
1291 aa  87.8  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  24.23 
 
 
1311 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 
981 aa  86.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  25.67 
 
 
1037 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  27.79 
 
 
1054 aa  85.1  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 
967 aa  84.7  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  24.34 
 
 
1402 aa  84.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  26.58 
 
 
1043 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.09 
 
 
1160 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  27.37 
 
 
1013 aa  83.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  25.57 
 
 
1123 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  31.25 
 
 
1074 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  28.39 
 
 
966 aa  82.8  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  25.99 
 
 
1055 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
1422 aa  81.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  20.77 
 
 
1826 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.39 
 
 
1067 aa  80.1  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  23.31 
 
 
1048 aa  80.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  32.62 
 
 
1051 aa  79.7  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.88 
 
 
1264 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
1014 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.01 
 
 
1089 aa  78.2  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0563  transcriptional regulatory protein-like protein  34.34 
 
 
678 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  28.16 
 
 
916 aa  77.8  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
1644 aa  77.8  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.81 
 
 
1013 aa  77.4  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  23.84 
 
 
2272 aa  75.9  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  38.95 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  36.23 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  36.23 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  36.23 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.54 
 
 
1805 aa  74.3  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.91 
 
 
1295 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  21.7 
 
 
1908 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  36.27 
 
 
409 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  39.34 
 
 
584 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.95 
 
 
1150 aa  73.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.05 
 
 
2279 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  27.9 
 
 
1744 aa  73.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  28.23 
 
 
1118 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5304  transcriptional regulator, CadC  42.55 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 
712 aa  72.4  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  26.81 
 
 
1118 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  34.88 
 
 
518 aa  72  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  26.47 
 
 
1139 aa  72  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  27.66 
 
 
970 aa  72  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  25.11 
 
 
1055 aa  71.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  31.87 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.9 
 
 
1422 aa  71.2  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
1383 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1412  response regulator receiver protein  33.66 
 
 
225 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.0125199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  35.87 
 
 
717 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  26.92 
 
 
1102 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  27.85 
 
 
1377 aa  70.1  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  26.08 
 
 
1143 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  26.26 
 
 
1090 aa  70.1  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  29.69 
 
 
906 aa  70.1  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0770  winged helix family two component transcriptional regulator  33.66 
 
 
225 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.10066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  25.24 
 
 
1063 aa  70.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  24.59 
 
 
1836 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.66 
 
 
1006 aa  70.1  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  37.11 
 
 
525 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3029  invasion protein regulator  38.04 
 
 
553 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0229765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3065  invasion protein regulator  38.04 
 
 
553 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.359189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  27.09 
 
 
1071 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2998  invasion protein regulator  38.04 
 
 
553 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000362876  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3186  invasion protein regulator  38.04 
 
 
555 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.735415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>