More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2140 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1153 aa  2157    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  42.2 
 
 		 1123 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.32 
 
 		 1150 aa  476  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  38.51 
 
 		 1118 aa  472  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  38.4 
 
 		 1121 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  47.06 
 
 		 1036 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  35.82 
 
 		 1114 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  59.49 
 
 		 655 aa  343  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  33.73 
 
 		 1090 aa  342  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  51.74 
 
 		 1123 aa  308  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 1161 aa  261  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  64.43 
 
 		 676 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  59.06 
 
 		 489 aa  250  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 1141 aa  231  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 723 aa  227  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 1141 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 1141 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  44.55 
 
 		 647 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 1141 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  45.71 
 
 		 969 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  49.72 
 
 		 628 aa  213  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 1118 aa  202  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  55.14 
 
 		 611 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  42.2 
 
 		 1733 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  43.28 
 
 		 957 aa  173  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  40.64 
 
 		 1000 aa  170  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 1148 aa  169  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  33.89 
 
 		 1071 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  42.86 
 
 		 1017 aa  165  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  40 
 
 		 1132 aa  164  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  47.08 
 
 		 1005 aa  164  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  42.81 
 
 		 1030 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  40.4 
 
 		 1102 aa  157  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 268 aa  152  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  41.46 
 
 		 950 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.86 
 
 		 1010 aa  152  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  40.83 
 
 		 1125 aa  152  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  37.73 
 
 		 981 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  38.48 
 
 		 965 aa  148  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.88 
 
 		 1092 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 1100 aa  147  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 1186 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.19 
 
 		 496 aa  145  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  41.28 
 
 		 1055 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  39.08 
 
 		 388 aa  145  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  40.18 
 
 		 1088 aa  145  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  43.21 
 
 		 1339 aa  145  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  39.85 
 
 		 1108 aa  145  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  39.12 
 
 		 940 aa  144  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  42.57 
 
 		 926 aa  142  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  38.14 
 
 		 1699 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  41.11 
 
 		 378 aa  140  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  36.78 
 
 		 1018 aa  138  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  29.11 
 
 		 1054 aa  138  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 297 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  40.43 
 
 		 919 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  41.13 
 
 		 1013 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  37.85 
 
 		 1025 aa  135  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 654 aa  135  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  40.55 
 
 		 910 aa  134  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  39.75 
 
 		 453 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  39.04 
 
 		 931 aa  134  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.78 
 
 		 996 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.34 
 
 		 1103 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 979 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  38.11 
 
 		 1097 aa  134  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.37 
 
 		 934 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 622 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 621 aa  132  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.86 
 
 		 960 aa  132  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  37.73 
 
 		 833 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.93 
 
 		 1022 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  39.57 
 
 		 1036 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.57 
 
 		 921 aa  129  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 943 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  43.65 
 
 		 385 aa  129  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  41.52 
 
 		 1072 aa  128  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  32.93 
 
 		 1027 aa  128  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  36.58 
 
 		 379 aa  127  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  40.74 
 
 		 1146 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  37.91 
 
 		 1054 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.15 
 
 		 1093 aa  127  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 968 aa  127  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 1071 aa  127  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 621 aa  126  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  39.13 
 
 		 1021 aa  126  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.88 
 
 		 1066 aa  126  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  43.15 
 
 		 1048 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.66 
 
 		 1029 aa  124  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.36 
 
 		 992 aa  124  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  37.27 
 
 		 921 aa  124  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 1003 aa  124  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.82 
 
 		 631 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 1158 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  36.48 
 
 		 970 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  34.52 
 
 		 981 aa  122  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 276 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 		 928 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.08 
 
 		 1087 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.09 
 
 		 992 aa  118  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>