More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7631 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  73.2 
 
 		 1123 aa  1413    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  100 
 
 		 1123 aa  2184    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  42.77 
 
 		 1121 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  39.86 
 
 		 1150 aa  572  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  42.64 
 
 		 1153 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  40.58 
 
 		 1118 aa  526  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  38.38 
 
 		 1036 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  35.16 
 
 		 1114 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  33.6 
 
 		 1090 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  32.47 
 
 		 1071 aa  314  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  42.64 
 
 		 1161 aa  311  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  33.33 
 
 		 1132 aa  273  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 1141 aa  249  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  52.88 
 
 		 489 aa  247  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 1148 aa  244  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  56.91 
 
 		 655 aa  239  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30 
 
 		 1141 aa  237  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30 
 
 		 1141 aa  237  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 1141 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  43.32 
 
 		 969 aa  221  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  54.72 
 
 		 676 aa  211  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 1198 aa  204  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 1118 aa  198  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  37.47 
 
 		 981 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.38 
 
 		 1146 aa  191  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  40.63 
 
 		 1000 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 723 aa  186  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 1005 aa  184  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  38.93 
 
 		 965 aa  181  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 1151 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.09 
 
 		 1029 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  41.37 
 
 		 1100 aa  175  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  47.33 
 
 		 611 aa  173  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  34.19 
 
 		 1030 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  38.05 
 
 		 1733 aa  171  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  40.4 
 
 		 1003 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.39 
 
 		 1017 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 1190 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  42.75 
 
 		 1339 aa  169  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 1186 aa  165  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  38.99 
 
 		 1025 aa  161  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  37.13 
 
 		 1022 aa  160  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  38.89 
 
 		 926 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 628 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.59 
 
 		 996 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.46 
 
 		 957 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 622 aa  158  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 1193 aa  157  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  28.89 
 
 		 1022 aa  155  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 268 aa  155  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  31.47 
 
 		 1054 aa  155  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.98 
 
 		 934 aa  154  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  41.31 
 
 		 378 aa  154  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.98 
 
 		 496 aa  153  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.25 
 
 		 940 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  32.55 
 
 		 1051 aa  152  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  35.42 
 
 		 1013 aa  151  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  33.59 
 
 		 992 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  33.98 
 
 		 1699 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  38.55 
 
 		 910 aa  150  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 654 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 1043 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  35.04 
 
 		 990 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  29.4 
 
 		 1010 aa  149  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.74 
 
 		 1125 aa  148  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.01 
 
 		 1018 aa  147  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.28 
 
 		 983 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.24 
 
 		 621 aa  146  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.23 
 
 		 1088 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  36.39 
 
 		 915 aa  145  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  41.13 
 
 		 1055 aa  145  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  40.32 
 
 		 647 aa  145  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 1071 aa  145  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.43 
 
 		 1102 aa  145  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 973 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  38.35 
 
 		 379 aa  144  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.5 
 
 		 1092 aa  144  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 621 aa  144  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.2 
 
 		 950 aa  144  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  36.64 
 
 		 971 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  30.8 
 
 		 668 aa  142  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.69 
 
 		 960 aa  142  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  35.4 
 
 		 983 aa  140  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  38.25 
 
 		 388 aa  140  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.91 
 
 		 989 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  34.25 
 
 		 1021 aa  138  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.95 
 
 		 1097 aa  138  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  32.82 
 
 		 1054 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 962 aa  137  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  36.78 
 
 		 1017 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.99 
 
 		 1126 aa  136  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  36.34 
 
 		 921 aa  135  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  40.07 
 
 		 385 aa  134  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  31.16 
 
 		 928 aa  134  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  36.91 
 
 		 1058 aa  134  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  34.1 
 
 		 916 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  38.58 
 
 		 931 aa  134  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.94 
 
 		 919 aa  133  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  37.64 
 
 		 1158 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.07 
 
 		 1093 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>