More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0735 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  100 
 
 		 1118 aa  2166    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  39.1 
 
 		 1090 aa  600  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  40.81 
 
 		 1150 aa  588  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  41.01 
 
 		 1121 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  39.53 
 
 		 1123 aa  519  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  41.18 
 
 		 1123 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  36.54 
 
 		 1114 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  35.12 
 
 		 1036 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  42.36 
 
 		 1161 aa  284  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  32.7 
 
 		 1132 aa  267  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  33.26 
 
 		 1071 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 1148 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 1141 aa  245  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 1141 aa  245  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.55 
 
 		 1141 aa  243  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  53.31 
 
 		 489 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 1141 aa  239  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  55.91 
 
 		 655 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 1198 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 969 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 1118 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  37.48 
 
 		 1153 aa  195  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  52.99 
 
 		 676 aa  193  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 723 aa  193  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  46.39 
 
 		 1000 aa  182  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  50.62 
 
 		 611 aa  181  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  42.53 
 
 		 1017 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.94 
 
 		 1146 aa  179  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 957 aa  173  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  44.98 
 
 		 1733 aa  171  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 654 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  45.72 
 
 		 965 aa  167  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  43.15 
 
 		 1339 aa  161  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 1151 aa  158  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.24 
 
 		 1022 aa  156  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 268 aa  154  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  41.57 
 
 		 1005 aa  154  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  38.11 
 
 		 1003 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.33 
 
 		 1029 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.54 
 
 		 1018 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  39.44 
 
 		 1102 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.09 
 
 		 940 aa  149  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 1100 aa  148  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 628 aa  148  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  41.11 
 
 		 647 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  42.62 
 
 		 950 aa  146  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  39.76 
 
 		 388 aa  145  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.96 
 
 		 1092 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  38.19 
 
 		 833 aa  144  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.85 
 
 		 1030 aa  144  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 968 aa  144  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  40.46 
 
 		 1125 aa  142  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 981 aa  141  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.68 
 
 		 1103 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  28.71 
 
 		 1054 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.47 
 
 		 931 aa  140  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  30.46 
 
 		 668 aa  138  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  38.52 
 
 		 453 aa  138  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  35.84 
 
 		 1025 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  40.88 
 
 		 1110 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  40.57 
 
 		 1093 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 		 926 aa  135  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 		 1158 aa  135  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  37.79 
 
 		 1004 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 952 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  40.07 
 
 		 385 aa  134  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  43.2 
 
 		 1055 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.93 
 
 		 981 aa  134  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.11 
 
 		 934 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.57 
 
 		 943 aa  132  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.95 
 
 		 496 aa  132  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 1058 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.88 
 
 		 1088 aa  132  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.18 
 
 		 1022 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.62 
 
 		 919 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  35.19 
 
 		 1011 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 1108 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.42 
 
 		 1006 aa  129  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 1190 aa  128  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 621 aa  127  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.62 
 
 		 1054 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.29 
 
 		 1010 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  33.88 
 
 		 1025 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  29.13 
 
 		 1051 aa  126  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 979 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  39.92 
 
 		 1036 aa  125  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  35.4 
 
 		 379 aa  125  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  36.02 
 
 		 1186 aa  125  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  37.55 
 
 		 1699 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 1319 aa  124  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.24 
 
 		 921 aa  124  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  34.96 
 
 		 297 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 1071 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 267 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  35.28 
 
 		 1087 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  32.18 
 
 		 621 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  36.16 
 
 		 1056 aa  121  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 1193 aa  121  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 622 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>