255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3349 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 628 aa  1172    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  58.51 
 
 		 655 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  53.22 
 
 		 647 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  54.53 
 
 		 676 aa  489  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  46.69 
 
 		 611 aa  331  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 489 aa  198  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  53.04 
 
 		 1036 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  50.6 
 
 		 1153 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  47.47 
 
 		 1123 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  48 
 
 		 1090 aa  188  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  49.8 
 
 		 1118 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  49.8 
 
 		 1121 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  47.45 
 
 		 969 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  45.2 
 
 		 1114 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  48.4 
 
 		 1150 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  49.41 
 
 		 1123 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  43.55 
 
 		 965 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  42.18 
 
 		 1339 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  44.77 
 
 		 1161 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 943 aa  137  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  38.35 
 
 		 981 aa  136  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  43.31 
 
 		 1005 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  41.13 
 
 		 1733 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  43.49 
 
 		 1132 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  39.45 
 
 		 934 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  38.82 
 
 		 1000 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  40.96 
 
 		 1003 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  40.21 
 
 		 1097 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.25 
 
 		 1018 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  43.03 
 
 		 1017 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 621 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  39.44 
 
 		 1071 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  43.39 
 
 		 1146 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  42.06 
 
 		 1125 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 1022 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  38.49 
 
 		 1004 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  41.13 
 
 		 1088 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  42 
 
 		 1055 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  40.64 
 
 		 1102 aa  122  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  40.91 
 
 		 1030 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 957 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 268 aa  120  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 1100 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  40.91 
 
 		 950 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  41.27 
 
 		 1110 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  42.86 
 
 		 1048 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  36.82 
 
 		 388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  38.34 
 
 		 833 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 1158 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  41.41 
 
 		 926 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  36.53 
 
 		 990 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  40.64 
 
 		 915 aa  117  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.22 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  40.16 
 
 		 668 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 1071 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.82 
 
 		 1092 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  35.43 
 
 		 1010 aa  113  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  37.25 
 
 		 990 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 968 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 1058 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 654 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.15 
 
 		 931 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  36.56 
 
 		 379 aa  111  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  39.04 
 
 		 1103 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 453 aa  111  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.18 
 
 		 1042 aa  110  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 1151 aa  110  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  35.02 
 
 		 981 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  37.5 
 
 		 992 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.29 
 
 		 1014 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  40.62 
 
 		 910 aa  109  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  36.65 
 
 		 919 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  40.59 
 
 		 1036 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  39.44 
 
 		 1025 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  36.55 
 
 		 1021 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  35.89 
 
 		 1003 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 1033 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.58 
 
 		 940 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  32 
 
 		 621 aa  107  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  36.8 
 
 		 1108 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  38.62 
 
 		 1011 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  38.52 
 
 		 989 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  38.74 
 
 		 1699 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  36.43 
 
 		 992 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 979 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 276 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 786 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 1186 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  37.11 
 
 		 1054 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  38.04 
 
 		 935 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  40.83 
 
 		 385 aa  104  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  40.91 
 
 		 954 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  36.25 
 
 		 1013 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  36.18 
 
 		 943 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.99 
 
 		 921 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  33.46 
 
 		 995 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 292 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.85 
 
 		 1022 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 268 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 370 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>