235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2165 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  68.75 
 
 		 655 aa  756    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 676 aa  1259    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 628 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  47.76 
 
 		 647 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  47.74 
 
 		 611 aa  392  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  52.85 
 
 		 1153 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  55.6 
 
 		 489 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  54.72 
 
 		 1123 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  43.45 
 
 		 1036 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  53.04 
 
 		 1121 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  52.99 
 
 		 1118 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  50 
 
 		 1114 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  52.21 
 
 		 969 aa  197  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  53.04 
 
 		 1090 aa  197  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  55.29 
 
 		 1123 aa  196  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  53.66 
 
 		 1150 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  45.02 
 
 		 1339 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  46.03 
 
 		 1733 aa  157  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  44.49 
 
 		 950 aa  153  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  43.9 
 
 		 965 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  42.51 
 
 		 1102 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 268 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  48.77 
 
 		 1161 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  43.55 
 
 		 1003 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  44.35 
 
 		 1055 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  40.78 
 
 		 1017 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 1005 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  41.87 
 
 		 1000 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  46.75 
 
 		 940 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.84 
 
 		 1103 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  44.22 
 
 		 1097 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  43.61 
 
 		 1132 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  41.83 
 
 		 957 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  41.77 
 
 		 1010 aa  137  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  39.36 
 
 		 1018 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  43.95 
 
 		 1125 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  40.89 
 
 		 1092 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  45.34 
 
 		 926 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  40.08 
 
 		 981 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  43.43 
 
 		 1699 aa  134  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  41.8 
 
 		 990 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  41.94 
 
 		 1030 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 1148 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 621 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  37.25 
 
 		 388 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 654 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  45.9 
 
 		 1025 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 1158 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 1151 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 1071 aa  127  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  35.98 
 
 		 297 aa  127  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  39.44 
 
 		 1013 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  43.72 
 
 		 910 aa  126  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  37.05 
 
 		 833 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.7 
 
 		 1088 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  43.09 
 
 		 668 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  40.78 
 
 		 1071 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  42.74 
 
 		 1036 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  41.7 
 
 		 935 aa  124  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  38.93 
 
 		 1017 aa  124  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  44.17 
 
 		 1146 aa  123  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  40.82 
 
 		 943 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  39.16 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 276 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  37.17 
 
 		 1108 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  39.36 
 
 		 1022 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  38.91 
 
 		 931 aa  121  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 1022 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  40.4 
 
 		 915 aa  120  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  36.64 
 
 		 1141 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.66 
 
 		 1100 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.23 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 1319 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 934 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  41.3 
 
 		 963 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35.98 
 
 		 960 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.84 
 
 		 921 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  38.31 
 
 		 453 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  35.92 
 
 		 1066 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  40.48 
 
 		 1110 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  36.86 
 
 		 1141 aa  114  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  37.97 
 
 		 379 aa  113  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 968 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 1186 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  38.71 
 
 		 1011 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 		 1004 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  38.76 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 622 aa  110  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  37.9 
 
 		 992 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  37.9 
 
 		 921 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 1346 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  41.7 
 
 		 1027 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.53 
 
 		 996 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 786 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.69 
 
 		 943 aa  107  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  36.22 
 
 		 981 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  32.13 
 
 		 621 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  39.68 
 
 		 1058 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.65 
 
 		 992 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  41.35 
 
 		 1048 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>