More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1038 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  100 
 
 		 1036 aa  1982    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  54.11 
 
 		 1056 aa  890    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  50.14 
 
 		 1110 aa  753    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  43.52 
 
 		 1087 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  41.3 
 
 		 1050 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 1058 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 1042 aa  551  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  41.34 
 
 		 1100 aa  542  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.22 
 
 		 1066 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  39.98 
 
 		 1097 aa  522  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  42.21 
 
 		 1072 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 1058 aa  499  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 		 1049 aa  492  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  40.5 
 
 		 1043 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  38.62 
 
 		 1093 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.51 
 
 		 1125 aa  465  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.19 
 
 		 1092 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.18 
 
 		 1055 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.02 
 
 		 1102 aa  452  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.7 
 
 		 1048 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.6 
 
 		 1017 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.51 
 
 		 1103 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 1094 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  39.78 
 
 		 1060 aa  426  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 1082 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  37.91 
 
 		 922 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.44 
 
 		 1028 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  41.47 
 
 		 957 aa  368  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  40.48 
 
 		 1158 aa  361  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  40.23 
 
 		 952 aa  332  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 1005 aa  331  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.22 
 
 		 960 aa  327  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 1005 aa  317  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  35.44 
 
 		 969 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  39.21 
 
 		 1018 aa  313  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  52.42 
 
 		 1186 aa  313  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 943 aa  301  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 781 aa  280  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.11 
 
 		 824 aa  280  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.25 
 
 		 999 aa  274  6e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  32.29 
 
 		 1064 aa  273  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 963 aa  264  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 775 aa  260  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 941 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  35.69 
 
 		 1131 aa  258  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  42.6 
 
 		 840 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.31 
 
 		 701 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  34.86 
 
 		 1227 aa  253  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  43.94 
 
 		 1119 aa  253  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 816 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 		 1076 aa  243  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  34.57 
 
 		 799 aa  241  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 950 aa  240  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 1027 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  38.19 
 
 		 792 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  40.27 
 
 		 1085 aa  235  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  37.43 
 
 		 980 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  39.81 
 
 		 760 aa  234  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 886 aa  233  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34.42 
 
 		 943 aa  231  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 1049 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 768 aa  228  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 814 aa  227  9e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 		 765 aa  225  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.76 
 
 		 916 aa  225  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 1079 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  35.52 
 
 		 630 aa  221  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  39.14 
 
 		 827 aa  220  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  35.41 
 
 		 818 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  36.78 
 
 		 1100 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 1161 aa  218  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 950 aa  218  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 1064 aa  218  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 1034 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.11 
 
 		 776 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 901 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01160  predicted ATPase  33.28 
 
 		 892 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  39.12 
 
 		 1104 aa  213  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 972 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 921 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  40.36 
 
 		 887 aa  211  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  38.68 
 
 		 961 aa  211  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 1060 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 1085 aa  208  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 882 aa  207  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  36.49 
 
 		 777 aa  207  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 1137 aa  206  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 959 aa  205  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 831 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  36.76 
 
 		 1044 aa  204  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  38.86 
 
 		 922 aa  203  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  38.78 
 
 		 780 aa  202  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 878 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  33.98 
 
 		 630 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  34 
 
 		 950 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  30.32 
 
 		 996 aa  197  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.75 
 
 		 966 aa  197  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 		 919 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 601 aa  194  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  37.19 
 
 		 779 aa  194  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>