More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6249 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  72.21 
 
 		 1161 aa  1269    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  48.75 
 
 		 1049 aa  712    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 1034 aa  755    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  100 
 
 		 1079 aa  2074    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  60.17 
 
 		 1060 aa  1000    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  53.2 
 
 		 1076 aa  912    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  34.68 
 
 		 1131 aa  341  4e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.08 
 
 		 1064 aa  336  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 1100 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 1093 aa  282  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 1066 aa  280  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.43 
 
 		 1092 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.51 
 
 		 1049 aa  270  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  35.49 
 
 		 1058 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.42 
 
 		 1042 aa  266  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  34.74 
 
 		 1050 aa  264  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 1058 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  35.66 
 
 		 1043 aa  257  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  32.46 
 
 		 1087 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.56 
 
 		 1102 aa  249  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 1097 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.41 
 
 		 1100 aa  247  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  33.11 
 
 		 1125 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  36.82 
 
 		 1056 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.51 
 
 		 1036 aa  239  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 1082 aa  237  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.38 
 
 		 1017 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  32.77 
 
 		 1018 aa  235  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  35.84 
 
 		 1110 aa  236  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.89 
 
 		 952 aa  231  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  39.33 
 
 		 922 aa  230  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.88 
 
 		 1103 aa  228  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  35.98 
 
 		 1072 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  33.93 
 
 		 1055 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.19 
 
 		 1085 aa  212  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 781 aa  210  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  33.13 
 
 		 957 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 886 aa  208  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 969 aa  207  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 1227 aa  206  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  34.03 
 
 		 1094 aa  203  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  34.28 
 
 		 943 aa  203  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  31.77 
 
 		 1060 aa  203  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 775 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 1137 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  37.84 
 
 		 792 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  37.96 
 
 		 1005 aa  201  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.35 
 
 		 999 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 755 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 1085 aa  192  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  38.56 
 
 		 840 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  36.78 
 
 		 916 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 963 aa  190  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 814 aa  189  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 1028 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  35.55 
 
 		 799 aa  189  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.51 
 
 		 1048 aa  189  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  39.94 
 
 		 824 aa  189  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  34.25 
 
 		 960 aa  187  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 882 aa  187  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  38.72 
 
 		 765 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  36.58 
 
 		 780 aa  185  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  35.79 
 
 		 1119 aa  185  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 877 aa  184  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.48 
 
 		 816 aa  184  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  36.83 
 
 		 887 aa  184  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 980 aa  184  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 948 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  33.26 
 
 		 827 aa  179  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 948 aa  180  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  41.16 
 
 		 1158 aa  178  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  35.89 
 
 		 618 aa  178  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 950 aa  175  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 973 aa  174  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 1141 aa  174  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 901 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 973 aa  173  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  34.98 
 
 		 760 aa  171  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 941 aa  170  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  38.27 
 
 		 878 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 931 aa  168  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 966 aa  167  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  40.24 
 
 		 644 aa  167  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  38.44 
 
 		 919 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 972 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  35.93 
 
 		 678 aa  164  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  39.43 
 
 		 938 aa  164  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  33.41 
 
 		 921 aa  161  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  38.63 
 
 		 601 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  38.29 
 
 		 591 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  31.15 
 
 		 777 aa  160  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 818 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  33.65 
 
 		 1014 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  32.13 
 
 		 1005 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 1001 aa  159  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  35.93 
 
 		 776 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  38.01 
 
 		 951 aa  159  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 973 aa  159  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 831 aa  158  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  36.08 
 
 		 768 aa  157  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>