More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1516 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 840 aa  1655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  40.49 
 
 		 780 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  40.14 
 
 		 792 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.36 
 
 		 701 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.53 
 
 		 960 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 775 aa  365  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 814 aa  353  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  36.66 
 
 		 776 aa  350  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  38.53 
 
 		 678 aa  343  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  32.09 
 
 		 777 aa  330  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  35.61 
 
 		 999 aa  308  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  44.93 
 
 		 760 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 755 aa  307  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.26 
 
 		 824 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  38.91 
 
 		 1085 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 1227 aa  281  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.55 
 
 		 1102 aa  280  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 886 aa  278  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.56 
 
 		 1049 aa  277  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  43.45 
 
 		 1087 aa  271  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.96 
 
 		 816 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 1066 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  47.5 
 
 		 1056 aa  264  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  41.26 
 
 		 1050 aa  264  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 1137 aa  263  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  33.06 
 
 		 1092 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  43.63 
 
 		 1103 aa  261  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 781 aa  259  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 1042 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  41.97 
 
 		 1017 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  42.14 
 
 		 1036 aa  254  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 1085 aa  252  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  42.76 
 
 		 1100 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  41.5 
 
 		 1125 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  38.28 
 
 		 1119 aa  249  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  35.85 
 
 		 644 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  41.65 
 
 		 1058 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  34.03 
 
 		 765 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  32.48 
 
 		 1097 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  39.72 
 
 		 1043 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 1093 aa  243  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  44.32 
 
 		 818 aa  243  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  41.88 
 
 		 799 aa  240  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 1082 aa  240  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 768 aa  240  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.05 
 
 		 827 aa  239  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  34.27 
 
 		 649 aa  238  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 882 aa  235  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  44.97 
 
 		 1055 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  41.45 
 
 		 1060 aa  230  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  35.22 
 
 		 916 aa  227  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  44.22 
 
 		 1110 aa  227  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 887 aa  226  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  35.51 
 
 		 969 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 1158 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  41.43 
 
 		 1094 aa  225  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  36.55 
 
 		 1010 aa  224  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 901 aa  224  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 957 aa  224  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  41.12 
 
 		 952 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 1058 aa  224  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 921 aa  223  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.15 
 
 		 950 aa  222  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  35.94 
 
 		 1072 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 601 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  45.7 
 
 		 418 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  41.09 
 
 		 1005 aa  213  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  38.28 
 
 		 1001 aa  211  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  32.87 
 
 		 982 aa  211  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 601 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.09 
 
 		 591 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 601 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  38.56 
 
 		 943 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 877 aa  208  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 910 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  36.73 
 
 		 1064 aa  207  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 888 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 591 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 966 aa  204  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  39.61 
 
 		 972 aa  203  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  43.95 
 
 		 938 aa  203  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 393 aa  202  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  38.87 
 
 		 973 aa  201  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  41.97 
 
 		 1005 aa  201  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.09 
 
 		 1104 aa  200  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 831 aa  200  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  32.92 
 
 		 907 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  37.39 
 
 		 779 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  31.59 
 
 		 1018 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 928 aa  197  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 973 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  39.23 
 
 		 961 aa  195  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  36.7 
 
 		 1076 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  39.76 
 
 		 1049 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.08 
 
 		 973 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  39.94 
 
 		 618 aa  193  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 941 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  40 
 
 		 658 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 804 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 		 1014 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>