More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1372 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1227 aa  2308    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  51.69 
 
 		 1125 aa  665    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  49.71 
 
 		 1102 aa  594  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  48.99 
 
 		 1103 aa  585  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  47.84 
 
 		 1092 aa  582  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  48.67 
 
 		 1055 aa  515  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  46.43 
 
 		 1017 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.37 
 
 		 1056 aa  334  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  36.94 
 
 		 1087 aa  318  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  36.2 
 
 		 1050 aa  316  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.07 
 
 		 1043 aa  313  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  33.96 
 
 		 1049 aa  307  8.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 1066 aa  301  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 775 aa  301  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.8 
 
 		 1085 aa  300  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 1100 aa  300  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 886 aa  297  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  42.37 
 
 		 792 aa  296  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.98 
 
 		 824 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 1085 aa  291  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.94 
 
 		 1058 aa  290  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.95 
 
 		 999 aa  288  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  40.57 
 
 		 1094 aa  284  8.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  36.45 
 
 		 1060 aa  284  9e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 1082 aa  283  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.17 
 
 		 816 aa  282  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.06 
 
 		 1058 aa  283  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  39.71 
 
 		 1072 aa  283  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  33.45 
 
 		 1042 aa  281  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  34.45 
 
 		 799 aa  281  7e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 781 aa  281  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 1097 aa  279  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  47.28 
 
 		 960 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  39.26 
 
 		 840 aa  275  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 1137 aa  273  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 882 aa  268  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.21 
 
 		 1048 aa  266  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  47.5 
 
 		 1158 aa  265  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  35.45 
 
 		 1110 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  35.02 
 
 		 701 aa  257  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 818 aa  254  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.18 
 
 		 1093 aa  252  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 901 aa  251  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  44.7 
 
 		 887 aa  251  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  46.99 
 
 		 1119 aa  249  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.71 
 
 		 1018 aa  249  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  34.04 
 
 		 1036 aa  247  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  35.63 
 
 		 776 aa  238  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  42.7 
 
 		 755 aa  234  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  38.6 
 
 		 760 aa  233  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  38.14 
 
 		 827 aa  231  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  37.14 
 
 		 1005 aa  227  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 888 aa  227  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.78 
 
 		 916 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 975 aa  225  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 814 aa  223  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  43.63 
 
 		 765 aa  222  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  35.92 
 
 		 922 aa  221  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 952 aa  218  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 736 aa  218  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  35.21 
 
 		 1060 aa  217  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 972 aa  217  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 1028 aa  217  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 831 aa  217  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.9 
 
 		 957 aa  214  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 1034 aa  214  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 1005 aa  213  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 872 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 910 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 969 aa  212  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  39.95 
 
 		 877 aa  212  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  40 
 
 		 678 aa  211  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 1186 aa  210  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 812 aa  210  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.95 
 
 		 966 aa  209  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 779 aa  208  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  37.76 
 
 		 780 aa  207  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 1076 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 973 aa  206  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  39.78 
 
 		 1010 aa  205  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  37.06 
 
 		 921 aa  205  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.44 
 
 		 768 aa  204  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  39.94 
 
 		 948 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.83 
 
 		 973 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  33.14 
 
 		 840 aa  204  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 954 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  31.97 
 
 		 1014 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 973 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 948 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 726 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 943 aa  199  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 618 aa  199  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  38.38 
 
 		 1131 aa  198  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  42.35 
 
 		 418 aa  198  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  40.33 
 
 		 919 aa  197  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 601 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  36.31 
 
 		 1049 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 1161 aa  196  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 1001 aa  195  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 601 aa  195  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>