More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2154 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 975 aa  1984    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 888 aa  343  7e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.15 
 
 		 816 aa  335  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 901 aa  323  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.9 
 
 		 999 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 872 aa  278  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 910 aa  275  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 799 aa  268  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 812 aa  254  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 802 aa  254  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 726 aa  251  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 768 aa  238  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 736 aa  238  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 831 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  32.22 
 
 		 921 aa  232  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  31.34 
 
 		 1085 aa  230  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 798 aa  229  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  32.59 
 
 		 916 aa  228  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 729 aa  227  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 781 aa  224  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  32.36 
 
 		 972 aa  225  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  30.01 
 
 		 1227 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  29.82 
 
 		 886 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  28.42 
 
 		 950 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  29.92 
 
 		 792 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  28.37 
 
 		 797 aa  217  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  28.35 
 
 		 1119 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  28.84 
 
 		 799 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  26.91 
 
 		 824 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  30.92 
 
 		 1042 aa  211  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 1085 aa  211  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  28.19 
 
 		 1092 aa  211  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  30.85 
 
 		 701 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  28.63 
 
 		 1125 aa  207  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  30.88 
 
 		 1056 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 775 aa  206  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  32.18 
 
 		 776 aa  204  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 804 aa  203  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 		 779 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 882 aa  202  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 887 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  31.67 
 
 		 960 aa  198  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  32.75 
 
 		 755 aa  198  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  30.17 
 
 		 1055 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 1137 aa  196  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  31.74 
 
 		 1066 aa  194  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  28.13 
 
 		 1056 aa  193  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 814 aa  191  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 954 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  30.48 
 
 		 996 aa  189  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  28.61 
 
 		 1017 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  29.92 
 
 		 765 aa  188  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 928 aa  187  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  31.44 
 
 		 840 aa  187  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 1049 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  30.93 
 
 		 1005 aa  185  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 966 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.77 
 
 		 1104 aa  184  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 877 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 973 aa  183  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  27.15 
 
 		 1103 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  27.14 
 
 		 1102 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  28.62 
 
 		 1010 aa  181  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  26.63 
 
 		 1072 aa  181  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 658 aa  181  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  26.62 
 
 		 827 aa  180  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  31.18 
 
 		 1058 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 950 aa  178  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  29.04 
 
 		 780 aa  178  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 591 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 601 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  26.45 
 
 		 961 aa  174  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  29.34 
 
 		 948 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 591 aa  174  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  26.89 
 
 		 1050 aa  174  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  29.04 
 
 		 678 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 1014 aa  173  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  31.31 
 
 		 1097 aa  172  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  30.83 
 
 		 1100 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 1001 aa  168  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  29.01 
 
 		 953 aa  167  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  28.67 
 
 		 760 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 231 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 959 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1493  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 233 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  31.48 
 
 		 906 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  28.64 
 
 		 992 aa  165  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 618 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  29.3 
 
 		 1110 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 948 aa  164  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  29.18 
 
 		 922 aa  164  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 973 aa  164  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 227 aa  163  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  30 
 
 		 1043 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1062  transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 933 aa  162  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 230 aa  162  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  33.24 
 
 		 1058 aa  162  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  25.81 
 
 		 1087 aa  161  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>