More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1062 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1062  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 933 aa  1837    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  27.92 
 
 		 816 aa  178  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  34.48 
 
 		 1055 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  32.16 
 
 		 1125 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 781 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  29.58 
 
 		 975 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 901 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  33.41 
 
 		 916 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  32.78 
 
 		 1103 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 755 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  33.4 
 
 		 1092 aa  151  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  33.69 
 
 		 840 aa  150  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 831 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 888 aa  150  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 872 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 882 aa  149  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  32.1 
 
 		 960 aa  148  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  32.75 
 
 		 768 aa  147  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  32.34 
 
 		 1056 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 		 1227 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  31.59 
 
 		 1102 aa  144  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 887 aa  144  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  30.69 
 
 		 1085 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  31.66 
 
 		 765 aa  142  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 1137 aa  141  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 736 aa  140  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  32 
 
 		 1017 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  32.92 
 
 		 1005 aa  140  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 814 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 726 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  31.57 
 
 		 1097 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  29.96 
 
 		 827 aa  138  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.28 
 
 		 1056 aa  138  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 973 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 910 aa  137  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  29.61 
 
 		 1100 aa  137  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  35.8 
 
 		 1049 aa  136  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  28.54 
 
 		 792 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.35 
 
 		 1104 aa  134  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 1085 aa  134  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  30 
 
 		 701 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  33.26 
 
 		 1141 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  30.84 
 
 		 1036 aa  132  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 818 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 775 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 804 aa  130  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  31.52 
 
 		 1131 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  31.81 
 
 		 1087 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0128  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 695 aa  129  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  32.02 
 
 		 1119 aa  129  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 966 aa  129  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  32.52 
 
 		 1066 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 802 aa  128  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  32.34 
 
 		 1058 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 952 aa  127  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  30.54 
 
 		 906 aa  127  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  31.52 
 
 		 1076 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  28.93 
 
 		 1014 aa  126  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 973 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  30.57 
 
 		 678 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 798 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  28.76 
 
 		 777 aa  125  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 1161 aa  125  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  31.6 
 
 		 1050 aa  124  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.07 
 
 		 957 aa  124  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  31.93 
 
 		 973 aa  124  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 		 886 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  30.17 
 
 		 780 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  28.05 
 
 		 950 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  32.33 
 
 		 969 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 799 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  29.85 
 
 		 799 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 393 aa  121  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  33.96 
 
 		 878 aa  121  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  29.87 
 
 		 1064 aa  120  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  33.98 
 
 		 1110 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  30.25 
 
 		 1072 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  30.63 
 
 		 824 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  34.29 
 
 		 1100 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  28.51 
 
 		 1049 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  31.11 
 
 		 644 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 618 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 943 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  28.42 
 
 		 797 aa  118  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 877 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 		 931 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  29.26 
 
 		 776 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 1079 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 812 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  32.18 
 
 		 1060 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  30.4 
 
 		 1058 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 972 aa  115  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  28.85 
 
 		 953 aa  114  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  34.11 
 
 		 1158 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  34.19 
 
 		 992 aa  112  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  31.74 
 
 		 922 aa  112  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  31.81 
 
 		 948 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 980 aa  111  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  31.68 
 
 		 996 aa  111  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>