More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0802 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 755 aa  1419    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  42.2 
 
 		 792 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.63 
 
 		 701 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.41 
 
 		 776 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 814 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 775 aa  382  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  41.94 
 
 		 960 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  38.74 
 
 		 765 aa  352  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  40.09 
 
 		 678 aa  336  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  39.12 
 
 		 840 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  38.09 
 
 		 886 aa  320  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.73 
 
 		 824 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 781 aa  303  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  36.94 
 
 		 799 aa  301  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  37.56 
 
 		 780 aa  299  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  44.63 
 
 		 1085 aa  299  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  39.81 
 
 		 760 aa  297  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  37.33 
 
 		 1119 aa  287  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.77 
 
 		 1125 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  35.33 
 
 		 768 aa  279  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  38.99 
 
 		 644 aa  273  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.54 
 
 		 816 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 1137 aa  264  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.06 
 
 		 999 aa  260  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  32.4 
 
 		 777 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  43.52 
 
 		 1102 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 882 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 		 1066 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.01 
 
 		 1017 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.57 
 
 		 957 aa  250  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  43.87 
 
 		 887 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  34.95 
 
 		 1103 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  42.92 
 
 		 1056 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  35.17 
 
 		 1049 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.37 
 
 		 1055 aa  244  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 1227 aa  243  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  34.38 
 
 		 1087 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 1085 aa  242  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  35.63 
 
 		 916 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  35.13 
 
 		 1060 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 1093 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  35.14 
 
 		 649 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  41.08 
 
 		 943 aa  233  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  45.36 
 
 		 1141 aa  231  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  41.47 
 
 		 952 aa  231  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 393 aa  230  6e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  34.62 
 
 		 1092 aa  230  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 969 aa  230  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  33.38 
 
 		 1058 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  32.85 
 
 		 1050 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 1097 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 901 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  32.7 
 
 		 1058 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.46 
 
 		 975 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  40.72 
 
 		 907 aa  220  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  41.7 
 
 		 982 aa  218  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  44.51 
 
 		 938 aa  217  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  43.61 
 
 		 919 aa  217  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  40.33 
 
 		 1076 aa  217  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 840 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 931 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 		 818 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 1043 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 831 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  35.05 
 
 		 1056 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  32.88 
 
 		 827 aa  211  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 972 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  42.56 
 
 		 1110 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 		 1049 aa  208  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 878 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  45.68 
 
 		 418 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 928 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 950 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 1082 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  37.38 
 
 		 1005 aa  204  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  38.93 
 
 		 1042 aa  204  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 910 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  40.73 
 
 		 1060 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  39.81 
 
 		 1131 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 1034 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 1100 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 888 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 1010 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.23 
 
 		 877 aa  194  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  41.72 
 
 		 1064 aa  194  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.46 
 
 		 921 aa  194  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 1100 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  42.78 
 
 		 1094 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 1079 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 973 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.31 
 
 		 973 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.31 
 
 		 973 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 941 aa  190  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  34.96 
 
 		 1072 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  38.81 
 
 		 943 aa  189  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  38.07 
 
 		 1001 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.86 
 
 		 1036 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  39.07 
 
 		 966 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>