256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1065 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  100 
 
 		 649 aa  1291    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  41.08 
 
 		 678 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  42.11 
 
 		 644 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 701 aa  326  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  33.38 
 
 		 792 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  34.01 
 
 		 776 aa  273  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.55 
 
 		 760 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  34.85 
 
 		 960 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 775 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  34.42 
 
 		 840 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 814 aa  210  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  36.61 
 
 		 755 aa  207  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  31.57 
 
 		 780 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  29.48 
 
 		 824 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  31.06 
 
 		 1085 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  30.47 
 
 		 1103 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  30.83 
 
 		 1125 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.03 
 
 		 999 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.87 
 
 		 1017 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  35.59 
 
 		 1056 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 882 aa  161  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 887 aa  161  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.32 
 
 		 957 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  33.72 
 
 		 1050 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 1137 aa  160  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  33.26 
 
 		 1119 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.76 
 
 		 943 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 		 768 aa  158  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  32.06 
 
 		 818 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 781 aa  158  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  30.24 
 
 		 928 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  33.56 
 
 		 1087 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.53 
 
 		 816 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  33.96 
 
 		 1227 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.63 
 
 		 1058 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  27.72 
 
 		 777 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  32.12 
 
 		 969 aa  154  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  33.94 
 
 		 1102 aa  153  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  33.57 
 
 		 1042 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 901 aa  151  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  29.35 
 
 		 1049 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  33.59 
 
 		 886 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  33.24 
 
 		 1010 aa  144  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  35.45 
 
 		 1110 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  31 
 
 		 877 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 393 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 919 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  35.9 
 
 		 916 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  28.73 
 
 		 1092 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 601 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  31.1 
 
 		 1018 aa  140  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 952 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 591 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 1085 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 418 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  33.74 
 
 		 1066 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 658 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 		 931 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 601 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 601 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  29.6 
 
 		 961 aa  136  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 966 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 1001 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 1043 aa  134  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  35.86 
 
 		 907 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  31.23 
 
 		 1158 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  27.56 
 
 		 765 aa  132  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 591 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  30.16 
 
 		 827 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.83 
 
 		 1097 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  31.73 
 
 		 799 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  29.07 
 
 		 1060 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  33.26 
 
 		 1093 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  27.85 
 
 		 972 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  36.92 
 
 		 1060 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  26.89 
 
 		 1014 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 948 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.22 
 
 		 1072 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  32.63 
 
 		 1055 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 948 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 872 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 973 aa  124  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 973 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1061  ATPase-like protein  32.06 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318774  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  29.38 
 
 		 982 aa  122  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  30.98 
 
 		 1100 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  33.24 
 
 		 1076 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  35.22 
 
 		 938 aa  120  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 1049 aa  120  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  29.47 
 
 		 906 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  31.28 
 
 		 1036 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 1034 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 1161 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  35.44 
 
 		 951 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  29.95 
 
 		 953 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  33.75 
 
 		 878 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 1141 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 736 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  26.93 
 
 		 975 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 804 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>