More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3610 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 840 aa  1652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  44.66 
 
 		 799 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.7 
 
 		 824 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  38.41 
 
 		 886 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  34.04 
 
 		 818 aa  323  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  31.39 
 
 		 827 aa  292  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.38 
 
 		 999 aa  261  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  29.33 
 
 		 792 aa  237  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  32.79 
 
 		 1125 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 781 aa  231  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  31.1 
 
 		 1085 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 1227 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  33.33 
 
 		 1102 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  30.24 
 
 		 1050 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 736 aa  208  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  31.89 
 
 		 960 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  30.43 
 
 		 1092 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  31.81 
 
 		 1103 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  26.5 
 
 		 816 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 768 aa  201  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  27.97 
 
 		 701 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  34.23 
 
 		 1055 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 882 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  30.81 
 
 		 1060 aa  197  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  34.55 
 
 		 1119 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 775 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  31.2 
 
 		 1087 aa  195  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  32.04 
 
 		 1017 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 1010 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.99 
 
 		 957 aa  190  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 814 aa  189  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 1137 aa  189  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  35.73 
 
 		 840 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  30.76 
 
 		 1056 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 831 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 952 aa  181  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 1001 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 872 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  27.26 
 
 		 901 aa  179  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  29.25 
 
 		 1042 aa  178  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 799 aa  177  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 1085 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 755 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  30.01 
 
 		 1072 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  32.35 
 
 		 1066 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 765 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 928 aa  170  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  32.4 
 
 		 887 aa  170  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 393 aa  168  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  29.08 
 
 		 1049 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  26.6 
 
 		 797 aa  167  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  32.31 
 
 		 1058 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  34.22 
 
 		 591 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  30.3 
 
 		 780 aa  163  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  31.32 
 
 		 776 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  29.26 
 
 		 1097 aa  162  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  33.89 
 
 		 591 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  28.6 
 
 		 1082 aa  161  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  32.13 
 
 		 1058 aa  161  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  32.52 
 
 		 779 aa  161  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  31.32 
 
 		 916 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  31.91 
 
 		 1014 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 490 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 726 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  29.61 
 
 		 760 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 601 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  24.9 
 
 		 975 aa  157  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 966 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  29.66 
 
 		 921 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 1043 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 798 aa  155  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  31.32 
 
 		 658 aa  155  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  31.78 
 
 		 678 aa  155  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 601 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 601 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 812 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  35.27 
 
 		 1110 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  32.55 
 
 		 973 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  28.83 
 
 		 1100 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  34.17 
 
 		 1036 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  32.55 
 
 		 973 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  29.55 
 
 		 950 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  30.02 
 
 		 1048 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 877 aa  147  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  31.61 
 
 		 943 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 948 aa  146  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 931 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 910 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  28.34 
 
 		 1018 aa  144  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.29 
 
 		 1104 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 729 aa  141  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  31.83 
 
 		 907 aa  141  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 969 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  31.58 
 
 		 982 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  31.22 
 
 		 1094 aa  138  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 948 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  34.5 
 
 		 919 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 972 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 888 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>