More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7942 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  100 
 
 		 824 aa  1621    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  43.31 
 
 		 799 aa  534  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  45.67 
 
 		 886 aa  534  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  39.93 
 
 		 818 aa  412  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  36.68 
 
 		 792 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  35.7 
 
 		 840 aa  379  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  35.78 
 
 		 827 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 775 aa  344  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  35.37 
 
 		 999 aa  337  5.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 781 aa  332  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  41.1 
 
 		 1085 aa  331  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.58 
 
 		 1102 aa  331  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  34.94 
 
 		 765 aa  325  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  34.97 
 
 		 1050 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.69 
 
 		 1058 aa  319  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  40 
 
 		 1087 aa  313  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.45 
 
 		 1125 aa  307  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.87 
 
 		 1092 aa  304  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  31.22 
 
 		 701 aa  299  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 1137 aa  298  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  36.71 
 
 		 1119 aa  296  8e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  38.13 
 
 		 1055 aa  295  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 1085 aa  295  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  36.69 
 
 		 1227 aa  293  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.92 
 
 		 1103 aa  291  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.18 
 
 		 768 aa  290  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  35.96 
 
 		 1056 aa  287  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.41 
 
 		 960 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  35.26 
 
 		 840 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.2 
 
 		 816 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 1042 aa  283  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  33.29 
 
 		 814 aa  281  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  36.51 
 
 		 1060 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  33.13 
 
 		 776 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 799 aa  273  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  46.26 
 
 		 1017 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  33.53 
 
 		 1097 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 1049 aa  270  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  35.82 
 
 		 1066 aa  270  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.55 
 
 		 1110 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 882 aa  263  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.34 
 
 		 1072 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  43.02 
 
 		 760 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  41.93 
 
 		 1094 aa  262  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 1058 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.35 
 
 		 1036 aa  259  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  43.97 
 
 		 887 aa  253  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  33.13 
 
 		 1100 aa  251  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 1093 aa  251  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 1043 aa  250  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  34.29 
 
 		 907 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 972 aa  245  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  40.13 
 
 		 916 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 755 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 393 aa  237  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 1082 aa  237  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 901 aa  237  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  36.22 
 
 		 678 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.42 
 
 		 957 aa  234  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.21 
 
 		 969 aa  231  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  40.57 
 
 		 950 aa  229  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  33.47 
 
 		 780 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 952 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  33.15 
 
 		 982 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  40.06 
 
 		 1010 aa  226  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  41.64 
 
 		 943 aa  224  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  41.31 
 
 		 877 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  34.01 
 
 		 1048 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 921 aa  221  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  40.05 
 
 		 931 aa  221  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  28.59 
 
 		 812 aa  215  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  40.53 
 
 		 601 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 658 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  41.42 
 
 		 591 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 948 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 973 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 591 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  26.91 
 
 		 975 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  41.12 
 
 		 601 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.32 
 
 		 973 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  41.12 
 
 		 601 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 928 aa  210  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 1001 aa  210  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  31.29 
 
 		 961 aa  208  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  36.91 
 
 		 490 aa  207  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  30.4 
 
 		 1018 aa  207  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  37.87 
 
 		 919 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  42.69 
 
 		 1158 aa  207  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 888 aa  207  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 966 aa  205  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 831 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  41.84 
 
 		 1064 aa  204  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  40.35 
 
 		 951 aa  203  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.12 
 
 		 948 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 802 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.48 
 
 		 1028 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  40.05 
 
 		 878 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  31.64 
 
 		 973 aa  201  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 959 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.14 
 
 		 1056 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>