253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6865 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  100 
 
 
701 aa  1425    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  40.63 
 
 
792 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  41.24 
 
 
678 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  42.45 
 
 
776 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.94 
 
 
960 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  41.61 
 
 
760 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
775 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  36.36 
 
 
840 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  36.57 
 
 
780 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
814 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  36.54 
 
 
644 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 
755 aa  351  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.92 
 
 
999 aa  325  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  42.25 
 
 
1085 aa  317  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  32.6 
 
 
649 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 
781 aa  302  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  39.64 
 
 
1119 aa  301  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  31.22 
 
 
824 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
1085 aa  296  7e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  32.6 
 
 
777 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  41.1 
 
 
1102 aa  287  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
882 aa  287  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 
765 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  40.14 
 
 
1050 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.67 
 
 
1087 aa  284  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
1137 aa  283  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 
1042 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.63 
 
 
1058 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  39.29 
 
 
1056 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.97 
 
 
1125 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  41.93 
 
 
887 aa  272  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.36 
 
 
816 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  41.9 
 
 
1058 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  33.98 
 
 
1049 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  32.8 
 
 
916 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  32.82 
 
 
768 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 
1066 aa  267  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.02 
 
 
1060 aa  267  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  37.4 
 
 
799 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  39.9 
 
 
952 aa  262  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.59 
 
 
1103 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  32.08 
 
 
969 aa  257  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  42.38 
 
 
1017 aa  257  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 
886 aa  256  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  34.24 
 
 
1227 aa  254  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.89 
 
 
1100 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  34.86 
 
 
1055 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  36.47 
 
 
957 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  38 
 
 
1093 aa  252  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
1082 aa  250  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  31.84 
 
 
972 aa  249  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.07 
 
 
966 aa  248  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.23 
 
 
1092 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
393 aa  246  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  33.12 
 
 
1001 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 
901 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.19 
 
 
877 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.88 
 
 
1043 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 
921 aa  244  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.96 
 
 
1036 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  32.92 
 
 
1010 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  35.63 
 
 
950 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  37.34 
 
 
818 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  43.62 
 
 
418 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  37.78 
 
 
591 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  37.26 
 
 
601 aa  231  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  37.27 
 
 
931 aa  230  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  37.5 
 
 
601 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  38.29 
 
 
591 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  37.5 
 
 
601 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  31.64 
 
 
961 aa  229  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  31.84 
 
 
982 aa  228  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.95 
 
 
1072 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 
943 aa  225  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  33.79 
 
 
928 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  34.74 
 
 
973 aa  224  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 
1097 aa  223  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  39.83 
 
 
490 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  33.03 
 
 
888 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  35.1 
 
 
827 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  31.32 
 
 
1018 aa  218  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  33.1 
 
 
831 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  31.41 
 
 
907 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  36.8 
 
 
973 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.41 
 
 
1110 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  41.26 
 
 
951 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  33.26 
 
 
779 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  36.6 
 
 
973 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  36.96 
 
 
658 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
726 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  31.6 
 
 
1048 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  31.77 
 
 
910 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  37.24 
 
 
948 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  31.01 
 
 
953 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  35.08 
 
 
1094 aa  207  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.85 
 
 
975 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
736 aa  204  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  36.84 
 
 
950 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.07 
 
 
1158 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  37.08 
 
 
878 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>