More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4643 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  46.1 
 
 		 1060 aa  684    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  50.47 
 
 		 1058 aa  841    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  52.21 
 
 		 1028 aa  795    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  100 
 
 		 1048 aa  2027    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  41.77 
 
 		 1056 aa  572  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 1097 aa  545  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.54 
 
 		 1087 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  38.99 
 
 		 1050 aa  499  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 1100 aa  499  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 		 1066 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  42.44 
 
 		 1110 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 1082 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.42 
 
 		 1043 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.9 
 
 		 1102 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.37 
 
 		 1125 aa  459  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  39.7 
 
 		 1036 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.87 
 
 		 1103 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 1058 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.08 
 
 		 1092 aa  449  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.76 
 
 		 1072 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.06 
 
 		 1042 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.9 
 
 		 1055 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  42 
 
 		 1049 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.11 
 
 		 1017 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  37.53 
 
 		 1094 aa  382  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 957 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  38 
 
 		 1005 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.86 
 
 		 1158 aa  352  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.41 
 
 		 960 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.7 
 
 		 952 aa  337  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 		 922 aa  335  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37 
 
 		 1018 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  47.87 
 
 		 1186 aa  305  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 969 aa  303  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 1227 aa  296  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  36.15 
 
 		 943 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.68 
 
 		 1005 aa  283  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 943 aa  263  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.01 
 
 		 824 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 781 aa  254  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.32 
 
 		 999 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  33.61 
 
 		 1064 aa  251  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 963 aa  250  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  35.26 
 
 		 1131 aa  249  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  31.6 
 
 		 701 aa  248  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  40.05 
 
 		 792 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  41.37 
 
 		 776 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 941 aa  243  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  41.28 
 
 		 1119 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.48 
 
 		 1085 aa  238  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 886 aa  238  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 775 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  39.57 
 
 		 765 aa  231  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  40.76 
 
 		 777 aa  230  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 1100 aa  226  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  34.53 
 
 		 1076 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  40.24 
 
 		 840 aa  224  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  35.84 
 
 		 980 aa  224  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  39.39 
 
 		 799 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 818 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 1034 aa  218  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  40.88 
 
 		 1010 aa  218  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  36.64 
 
 		 827 aa  217  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  37.37 
 
 		 916 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 816 aa  217  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 1085 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 1137 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 1161 aa  214  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 1049 aa  213  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 630 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  39.18 
 
 		 755 aa  210  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  36.16 
 
 		 1079 aa  207  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 901 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  38.31 
 
 		 973 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 1060 aa  205  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 973 aa  205  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.08 
 
 		 760 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 887 aa  205  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 882 aa  204  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  37.26 
 
 		 922 aa  204  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 973 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  38.8 
 
 		 1001 aa  201  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  36.24 
 
 		 618 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  38.76 
 
 		 948 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 814 aa  199  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 948 aa  197  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  38.61 
 
 		 972 aa  197  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.01 
 
 		 1088 aa  196  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  33.78 
 
 		 630 aa  194  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 1014 aa  193  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01160  predicted ATPase  33.21 
 
 		 892 aa  193  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 393 aa  192  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 601 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  36.24 
 
 		 1141 aa  190  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1027 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  33.57 
 
 		 950 aa  189  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  35.19 
 
 		 780 aa  188  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 831 aa  188  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 658 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  36.67 
 
 		 1000 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>