More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1442 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  100 
 
 
888 aa  1803    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  33.5 
 
 
975 aa  357  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
816 aa  327  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
799 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.79 
 
 
999 aa  278  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 
901 aa  275  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 
910 aa  267  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
726 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.82 
 
 
872 aa  250  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 
798 aa  246  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  34.48 
 
 
916 aa  244  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  32.68 
 
 
1227 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  32.51 
 
 
1085 aa  233  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  32.41 
 
 
779 aa  231  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  32.38 
 
 
1056 aa  231  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  34.4 
 
 
792 aa  230  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  30.25 
 
 
966 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  29.54 
 
 
768 aa  227  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  33.86 
 
 
701 aa  227  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  29.87 
 
 
824 aa  226  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  28.51 
 
 
1119 aa  224  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 
950 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  32.79 
 
 
960 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 
765 aa  222  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  29.37 
 
 
812 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 
831 aa  220  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
775 aa  219  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  33.26 
 
 
1092 aa  218  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  30.46 
 
 
1049 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 
1066 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
736 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
814 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
781 aa  214  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  32.31 
 
 
760 aa  213  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  30.3 
 
 
972 aa  212  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  32.92 
 
 
1097 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  28.89 
 
 
921 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  32.31 
 
 
840 aa  211  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 
804 aa  210  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  29.79 
 
 
961 aa  210  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  27.48 
 
 
1087 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 
1100 aa  208  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  27.53 
 
 
1125 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.57 
 
 
1104 aa  204  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  32.01 
 
 
1102 aa  204  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  29.78 
 
 
928 aa  203  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  30.99 
 
 
618 aa  202  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  32.09 
 
 
1050 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.92 
 
 
957 aa  201  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.71 
 
 
952 aa  200  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  27.96 
 
 
799 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  30.66 
 
 
973 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
1137 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  28.53 
 
 
996 aa  198  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  31.26 
 
 
776 aa  198  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  27.81 
 
 
856 aa  197  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.69 
 
 
1043 aa  197  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  31.9 
 
 
1110 aa  197  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
1082 aa  197  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  32.76 
 
 
959 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  30.21 
 
 
906 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  27.29 
 
 
797 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
1085 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  30.4 
 
 
780 aa  196  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  27.92 
 
 
1010 aa  196  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  31.47 
 
 
1072 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  30.16 
 
 
1058 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  28.81 
 
 
1014 aa  195  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  30.5 
 
 
1056 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  30.39 
 
 
973 aa  194  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 
802 aa  194  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  29.83 
 
 
1058 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  31.79 
 
 
950 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  29.13 
 
 
953 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  33.68 
 
 
1017 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  30.3 
 
 
948 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
729 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  27.16 
 
 
992 aa  191  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  32.77 
 
 
755 aa  191  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  28.44 
 
 
991 aa  191  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
882 aa  190  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  28.86 
 
 
973 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  27.04 
 
 
956 aa  189  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 
943 aa  189  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  33.33 
 
 
887 aa  189  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  33.26 
 
 
969 aa  189  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  30.28 
 
 
877 aa  188  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  29.9 
 
 
1042 aa  187  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  33.58 
 
 
919 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  26.93 
 
 
1055 aa  185  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  26.62 
 
 
1103 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  32.83 
 
 
1036 aa  184  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  27.59 
 
 
1001 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  30.09 
 
 
948 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  30.2 
 
 
678 aa  181  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  30.15 
 
 
946 aa  181  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  29.96 
 
 
1005 aa  180  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  28.77 
 
 
591 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  27.94 
 
 
658 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  26.59 
 
 
886 aa  179  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>