197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10913 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
393 aa  798    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  55.89 
 
 
1085 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
1137 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
882 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  53.68 
 
 
887 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  49.86 
 
 
1085 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  42.74 
 
 
701 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  44.99 
 
 
1119 aa  245  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 
1066 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  41.26 
 
 
824 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  41.85 
 
 
960 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  39.66 
 
 
1050 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 
1042 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  44.8 
 
 
781 aa  225  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  38.8 
 
 
792 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 
755 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
775 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  42.23 
 
 
952 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.43 
 
 
957 aa  219  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.29 
 
 
1017 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  39.67 
 
 
827 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  41.29 
 
 
1058 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  37.97 
 
 
760 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.57 
 
 
1056 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.41 
 
 
886 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 
921 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 
1058 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  40.5 
 
 
799 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  45.65 
 
 
919 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  40.56 
 
 
969 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.65 
 
 
1087 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  39.54 
 
 
776 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.94 
 
 
1043 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 
765 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.88 
 
 
1097 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  40.11 
 
 
1093 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  38.27 
 
 
1049 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  39.26 
 
 
840 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  37.98 
 
 
1141 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  35.2 
 
 
999 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  38.37 
 
 
678 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  36.72 
 
 
973 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.78 
 
 
1102 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  35.9 
 
 
973 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.14 
 
 
1125 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 
818 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  36.89 
 
 
948 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 
950 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.64 
 
 
1092 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  36.75 
 
 
877 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  37.82 
 
 
916 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.86 
 
 
1110 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  37.22 
 
 
948 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.1 
 
 
972 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.78 
 
 
1055 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.55 
 
 
1227 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  38.32 
 
 
878 aa  190  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  39.16 
 
 
951 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.1 
 
 
1103 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 
938 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
814 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  39.78 
 
 
1060 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  37.65 
 
 
931 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  36.18 
 
 
1010 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  38.9 
 
 
943 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  37.71 
 
 
1001 aa  186  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.38 
 
 
816 aa  186  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  40.11 
 
 
1072 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  34.38 
 
 
973 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 
1094 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  36.34 
 
 
907 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  33.8 
 
 
966 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  32.28 
 
 
490 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  37.33 
 
 
982 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  39.31 
 
 
1005 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  36.6 
 
 
780 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  34.93 
 
 
901 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  35.31 
 
 
777 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.96 
 
 
1036 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3572  transcriptional regulator, LuxR family  38.44 
 
 
914 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  36.39 
 
 
658 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.46 
 
 
1100 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  34.66 
 
 
618 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  38.3 
 
 
1018 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  37.39 
 
 
601 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  34.9 
 
 
928 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  35.13 
 
 
961 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  37.39 
 
 
601 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  37.39 
 
 
601 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
1082 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  35.96 
 
 
418 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  36.22 
 
 
1131 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
1014 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  36.04 
 
 
1064 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  33.24 
 
 
493 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  37.72 
 
 
591 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  33.24 
 
 
493 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  33.87 
 
 
906 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  32.95 
 
 
493 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 
975 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>