More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0191 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
775 aa  1544    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  56.7 
 
 
792 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
814 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  43.25 
 
 
960 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.88 
 
 
776 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.94 
 
 
701 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 
755 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  38.55 
 
 
840 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
781 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.71 
 
 
824 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  36.31 
 
 
765 aa  369  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  41.47 
 
 
1085 aa  353  8e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  37.08 
 
 
678 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  36.64 
 
 
780 aa  327  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.69 
 
 
1227 aa  323  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.5 
 
 
1125 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.64 
 
 
1102 aa  320  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
1137 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  39.26 
 
 
1103 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  39.01 
 
 
760 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  43.92 
 
 
1087 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  38.93 
 
 
886 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  41.5 
 
 
1056 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  35.3 
 
 
999 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.78 
 
 
816 aa  299  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  34.76 
 
 
799 aa  296  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 
768 aa  294  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 
1066 aa  293  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.71 
 
 
1092 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  43.19 
 
 
1058 aa  290  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  39.17 
 
 
1119 aa  288  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  43.9 
 
 
1050 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
882 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  38.56 
 
 
644 aa  283  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.18 
 
 
1017 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  42.62 
 
 
887 aa  281  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  37.18 
 
 
649 aa  277  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 
1058 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
1085 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.17 
 
 
1110 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  35.24 
 
 
901 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 
1097 aa  271  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 
1042 aa  271  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  43.91 
 
 
1036 aa  266  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.67 
 
 
1100 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.56 
 
 
1055 aa  265  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.83 
 
 
1043 aa  260  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
1082 aa  257  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34.52 
 
 
952 aa  257  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  38.84 
 
 
1072 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.78 
 
 
1049 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  30.41 
 
 
777 aa  250  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  41.25 
 
 
601 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
799 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  33.39 
 
 
957 aa  248  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.71 
 
 
877 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.44 
 
 
591 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  43.26 
 
 
1093 aa  246  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  42.96 
 
 
1060 aa  247  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  37.97 
 
 
966 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  41.11 
 
 
601 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  41.11 
 
 
601 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  39.7 
 
 
591 aa  244  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
393 aa  240  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  44.88 
 
 
418 aa  237  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  44.04 
 
 
1094 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.88 
 
 
969 aa  236  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.04 
 
 
827 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  33.8 
 
 
916 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  35.73 
 
 
1010 aa  230  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  36.85 
 
 
1001 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  41.71 
 
 
1158 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  32.33 
 
 
921 aa  227  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.17 
 
 
972 aa  227  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  29.46 
 
 
888 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  29.72 
 
 
975 aa  223  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  38.88 
 
 
907 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  40.67 
 
 
943 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.33 
 
 
1018 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  40.18 
 
 
982 aa  220  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  31.8 
 
 
961 aa  220  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 
950 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
798 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  37.13 
 
 
928 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 
1005 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 
919 aa  212  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  41.47 
 
 
1048 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  39.38 
 
 
490 aa  211  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  37.88 
 
 
1076 aa  211  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  31.3 
 
 
910 aa  210  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  37.29 
 
 
973 aa  209  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  39.03 
 
 
931 aa  207  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  33.63 
 
 
779 aa  206  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  39.86 
 
 
1034 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  33.89 
 
 
950 aa  206  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  40.64 
 
 
1161 aa  205  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
726 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 
812 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.45 
 
 
973 aa  204  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.66 
 
 
973 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>