More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5928 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 1085 aa  2147    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  59.17 
 
 		 1085 aa  1131    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  56.11 
 
 		 882 aa  877    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  53.24 
 
 		 887 aa  781    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  72.58 
 
 		 1137 aa  1486    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  55.89 
 
 		 393 aa  382  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  37.79 
 
 		 907 aa  352  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 781 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  40.83 
 
 		 792 aa  336  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 775 aa  335  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  45.61 
 
 		 1119 aa  334  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.97 
 
 		 1125 aa  333  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  39.15 
 
 		 824 aa  332  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  42.8 
 
 		 886 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.7 
 
 		 960 aa  318  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  46.08 
 
 		 1087 aa  317  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  42.25 
 
 		 701 aa  317  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  37.72 
 
 		 982 aa  316  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 1066 aa  311  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  39.77 
 
 		 999 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.02 
 
 		 1092 aa  301  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  39.36 
 
 		 799 aa  301  5e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.97 
 
 		 1103 aa  301  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 878 aa  300  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  40.66 
 
 		 1050 aa  299  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  39.63 
 
 		 1227 aa  298  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  35.12 
 
 		 1056 aa  298  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  37.98 
 
 		 1141 aa  295  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  41.24 
 
 		 760 aa  293  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  42.79 
 
 		 1102 aa  293  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  39.7 
 
 		 969 aa  287  7e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.68 
 
 		 1017 aa  287  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 755 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  38.53 
 
 		 840 aa  280  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  33.46 
 
 		 816 aa  280  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  39.87 
 
 		 776 aa  280  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  41.2 
 
 		 678 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  36.69 
 
 		 765 aa  280  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  40.42 
 
 		 1042 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 814 aa  278  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 1100 aa  275  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 1058 aa  274  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.83 
 
 		 952 aa  273  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.8 
 
 		 957 aa  273  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.3 
 
 		 916 aa  271  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  31.59 
 
 		 1049 aa  271  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  41.46 
 
 		 1060 aa  271  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 1097 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  38.4 
 
 		 950 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  43.88 
 
 		 1110 aa  263  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  42.04 
 
 		 919 aa  262  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 1043 aa  261  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 921 aa  261  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 931 aa  260  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.87 
 
 		 1058 aa  260  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10910  transcriptional regulator  65.5 
 
 		 285 aa  258  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.99 
 
 		 1055 aa  258  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  45.41 
 
 		 951 aa  257  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.7 
 
 		 1072 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  34.78 
 
 		 780 aa  250  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  31.97 
 
 		 972 aa  250  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 1093 aa  245  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 877 aa  244  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 818 aa  243  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.77 
 
 		 768 aa  243  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 943 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.51 
 
 		 1094 aa  241  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 1082 aa  241  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  33.49 
 
 		 1010 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  37.25 
 
 		 827 aa  240  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 1001 aa  240  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 601 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 901 aa  239  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 601 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 601 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  41.19 
 
 		 973 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40.89 
 
 		 591 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 658 aa  234  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 973 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  35.49 
 
 		 1158 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2078  transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 940 aa  232  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.9735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  41.71 
 
 		 948 aa  231  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  42.41 
 
 		 948 aa  231  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  37.58 
 
 		 953 aa  230  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  31.34 
 
 		 975 aa  230  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.51 
 
 		 888 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.41 
 
 		 591 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 973 aa  228  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  40.27 
 
 		 1036 aa  228  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.9 
 
 		 1005 aa  226  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  38.23 
 
 		 966 aa  224  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  32.03 
 
 		 777 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 961 aa  221  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 928 aa  220  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  41.64 
 
 		 938 aa  220  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 726 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.97 
 
 		 1064 aa  219  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 980 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 910 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  31.26 
 
 		 812 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>